АвторТема: Компания Dante Labs  (Прочитано 37494 раз)

Saken и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #195 : 26 Ноябрь 2018, 00:28:26 »
Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 301
  • Страна: ru
  • Рейтинг +152/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #196 : 26 Ноябрь 2018, 21:46:36 »
В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 181
  • Рейтинг +124/-1
  • Y-ДНК: ЖМ: N1c-Z1939
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #197 : 26 Ноябрь 2018, 22:55:01 »
В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

DanteLabs дают сырые данные в форме FASTQ и BAM, выравнивай под какой геном хочешь. Я заказывал и выравнивал сам.

Оффлайн Yury_kh

  • Сообщений: 4
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-30
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #198 : 27 Ноябрь 2018, 00:17:42 »
На сервисе Sequencing  можно из ВАМ сделать разные выходные форматы данных. Есть приложение, которое генерит файлы с указанными параметрами.

Хотел сделать файл в формате 23andme, чтобы загрузить в MyHeritage (для начала), я меня там есть аккаунт и дерево. Однако сделанный файл "не взялся", сайт говорит - нечитаемый формат. Подскажите пожалуйста, какие опции нужно выставить в конвертере? Ну или другими словами, какие особенности формата данных 23andme?

Заранее спасибо за помощь  :)


Оффлайн KetoDude

  • Сообщений: 15
  • Страна: us
  • Рейтинг +2/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #199 : 27 Ноябрь 2018, 05:37:09 »
В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

DanteLabs дают сырые данные в форме FASTQ и BAM, выравнивай под какой геном хочешь. Я заказывал и выравнивал сам.
ага, причем даже hg38 покрывает далеко не все вариации.
Вот, например, нашли еще 10%, которых нет в hg38  :o
https://arstechnica.com/science/2018/11/our-human-reference-genome-is-missing-a-lot-of-material/

Оффлайн Ksenia365

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #200 : 27 Ноябрь 2018, 13:23:40 »
Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.
заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

Оффлайн bulatv2

  • Сообщений: 191
  • Страна: ru
  • Рейтинг +49/-0
  • ftdna: 468412
  • Y-ДНК: R1a-Z92(YP682+)
  • мтДНК: H1b2
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #201 : 27 Ноябрь 2018, 13:31:18 »
Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.
заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку
мне тоже писали что 3 декабря отправят хотя я 19.11 оплачивал

Оффлайн Kote

  • Сообщений: 75
  • Страна: ru
  • Рейтинг +55/-0
  • I1–VISTULA
  • Y-ДНК: I1-Y6351+
  • мтДНК: H6a1a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #202 : 27 Ноябрь 2018, 20:13:11 »
Мне сегодня таким вот текстом ответили: "Извините за задержку отправки. Ваш заказ будет выполнен в следующие несколько дней" Обнадёжили, короче...)

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #203 : 28 Ноябрь 2018, 08:45:35 »
заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку
Интересно. А каким способом они отправили? Через DHL?

Оффлайн Ksenia365

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #204 : 28 Ноябрь 2018, 13:18:35 »
заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку
Интересно. А каким способом они отправили? Через DHL?
DHL

Оффлайн Evgeny Kolchugin

  • Сообщений: 385
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #205 : 28 Ноябрь 2018, 16:52:30 »
Полное секвенирование генома WGS - 169 евро в Данте. Распродажа в честь Черной Пятницы и заканчивается в понедельник.
А можно узнать, что с этими данными делать потом? В Гедматч и YFull загрузить получится?

Оффлайн Пашкевич Павел

  • Сообщений: 89
  • Страна: by
  • Рейтинг +60/-0
  • Y-ДНК: I1 -Y7477
  • мтДНК: H1b2
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #206 : 28 Ноябрь 2018, 17:22:21 »
в yfull и на гедматч говорят тут можно закачать 8)

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2213
  • Страна: ru
  • Рейтинг +485/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #207 : 28 Ноябрь 2018, 17:49:07 »
в yfull и на гедматч говорят тут можно закачать 8)
gedmatch genesis. В gedmatch не загрузится.

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #208 : 06 Декабрь 2018, 12:02:02 »
Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.
Вчера вечером пришло письмо об отправке. Отправили почтой Нидерландов (PostNL).

Оффлайн rmk

  • Сообщений: 169
  • Страна: ru
  • Рейтинг +110/-30
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #209 : 28 Декабрь 2018, 19:37:57 »
В среду получил тестовый набор. Dante Labs ранее прислали по эл. почте предоплаченный ярлык для возврата UPS, но не удалось им воспользоваться. В UPS по телефону стали убедительно просить не пытаться отправлять через них какие-либо пробирки, с чем бы они ни были. Дескать, потребуется экспертиза вещества и множество документов без гарантий результата. В итоге отправил сегодня "Почтой России".

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100