Компания Dante Labs

[Kote]

ЛОНДОН , 23 ноября 2018 г. / PRNewswire / -

Международная биотехнологическая компания Dante Labs расширила свое секвенирование генома фармакогеномным анализом, который измеряет реакцию на более чем 100 лекарств. Отчет добавляется бесплатно к его цельной последовательности генома и WholeGenomeZ предложение

Международная биотехнологическая компания Dante Labs объявила сегодня о запуске фармакогеномического отчета для всех тестов на определение генома. Отчет будет доступен для всех клиентов за пределами США и Канады . Предыдущие пациенты также получат отчет бесплатно.

Источник: https://markets.businessinsider.com/news/stocks/dante-labs-adds-pharmacogenomic-analysis-for-100-drugs-on-amazon-and-for-black-friday-offer-1027751068

[KetoDude]

Да, народ просит, чтобы откорректировали противоречивую информацию. Еще те, кто оплатил жесткий диск, могут написать на contact@dantelabs.com и отменить его заказ, если не нужен

Все-таки жесткий диск заказывать придется
"You will definitely be able to download the raw data in the future, but I cannot give you an ETA on that as we are still in the process of building the required informatic infrastructure. The HDD is currently the fastest way to receive the data."

Однако выбил 50% скидку для тех кто заказывает несколько геномов 
"We can put the raw data from 2 whole genomes on a 500GB HDD. If you want the data from multiple kits, you should buy an HDD for each kit but you can use this discount code to have a 50% discount: SPECIALHD."

[NathanS]

Кому интересно:

Полное секвенирование генома WGS - 169 евро в Данте. Распродажа в честь Черной Пятницы и заканчивается в понедельник.

[rmk]

Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

[Ankor]

В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

[NathanS]

В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

DanteLabs дают сырые данные в форме FASTQ и BAM, выравнивай под какой геном хочешь. Я заказывал и выравнивал сам.

[Yury_kh]

На сервисе Sequencing  можно из ВАМ сделать разные выходные форматы данных. Есть приложение, которое генерит файлы с указанными параметрами.

Хотел сделать файл в формате 23andme, чтобы загрузить в MyHeritage (для начала), я меня там есть аккаунт и дерево. Однако сделанный файл "не взялся", сайт говорит - нечитаемый формат. Подскажите пожалуйста, какие опции нужно выставить в конвертере? Ну или другими словами, какие особенности формата данных 23andme?

Заранее спасибо за помощь 

[KetoDude]

В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

DanteLabs дают сырые данные в форме FASTQ и BAM, выравнивай под какой геном хочешь. Я заказывал и выравнивал сам.

ага, причем даже hg38 покрывает далеко не все вариации.
Вот, например, нашли еще 10%, которых нет в hg38 
https://arstechnica.com/science/2018/11/our-human-reference-genome-is-missing-a-lot-of-material/

[Ksenia365]

Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

[bulatv2]

Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

мне тоже писали что 3 декабря отправят хотя я 19.11 оплачивал

[Kote]

Мне сегодня таким вот текстом ответили: "Извините за задержку отправки. Ваш заказ будет выполнен в следующие несколько дней" Обнадёжили, короче...)

[rmk]

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

Интересно. А каким способом они отправили? Через DHL?

[Ksenia365]

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

Интересно. А каким способом они отправили? Через DHL?

DHL

[Evgeny Kolchugin]

Полное секвенирование генома WGS - 169 евро в Данте. Распродажа в честь Черной Пятницы и заканчивается в понедельник.

А можно узнать, что с этими данными делать потом? В Гедматч и YFull загрузить получится?

[Пашкевич Павел]

в yfull и на гедматч говорят тут можно закачать