Компания Dante Labs

[rmk]

Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

[Ankor]

В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

[NathanS]

В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

DanteLabs дают сырые данные в форме FASTQ и BAM, выравнивай под какой геном хочешь. Я заказывал и выравнивал сам.

[Yury_kh]

На сервисе Sequencing  можно из ВАМ сделать разные выходные форматы данных. Есть приложение, которое генерит файлы с указанными параметрами.

Хотел сделать файл в формате 23andme, чтобы загрузить в MyHeritage (для начала), я меня там есть аккаунт и дерево. Однако сделанный файл "не взялся", сайт говорит - нечитаемый формат. Подскажите пожалуйста, какие опции нужно выставить в конвертере? Ну или другими словами, какие особенности формата данных 23andme?

Заранее спасибо за помощь 

[KetoDude]

В Интернете пишут, что по умолчанию Dante Labs делает выравнивание по hg19, и что надо заранее им писать и просить сделать выравнивание по hg38.

DanteLabs дают сырые данные в форме FASTQ и BAM, выравнивай под какой геном хочешь. Я заказывал и выравнивал сам.

ага, причем даже hg38 покрывает далеко не все вариации.
Вот, например, нашли еще 10%, которых нет в hg38 
https://arstechnica.com/science/2018/11/our-human-reference-genome-is-missing-a-lot-of-material/

[Ksenia365]

Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

[bulatv2]

Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

мне тоже писали что 3 декабря отправят хотя я 19.11 оплачивал

[Kote]

Мне сегодня таким вот текстом ответили: "Извините за задержку отправки. Ваш заказ будет выполнен в следующие несколько дней" Обнадёжили, короче...)

[rmk]

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

Интересно. А каким способом они отправили? Через DHL?

[Ksenia365]

заказала 21.11 сегодня уже получила пробирку

Интересно. А каким способом они отправили? Через DHL?

DHL

[Evgeny Kolchugin]

Полное секвенирование генома WGS - 169 евро в Данте. Распродажа в честь Черной Пятницы и заканчивается в понедельник.

А можно узнать, что с этими данными делать потом? В Гедматч и YFull загрузить получится?

[Пашкевич Павел]

в yfull и на гедматч говорят тут можно закачать

[ankr21]

в yfull и на гедматч говорят тут можно закачать

gedmatch genesis. В gedmatch не загрузится.

[rmk]

Тоже вчера заказал на пробу один тест, ничего не смог с собой поделать. Написали, что заказ будет обработан после 3 декабря.

Вчера вечером пришло письмо об отправке. Отправили почтой Нидерландов (PostNL).

[rmk]

В среду получил тестовый набор. Dante Labs ранее прислали по эл. почте предоплаченный ярлык для возврата UPS, но не удалось им воспользоваться. В UPS по телефону стали убедительно просить не пытаться отправлять через них какие-либо пробирки, с чем бы они ни были. Дескать, потребуется экспертиза вещества и множество документов без гарантий результата. В итоге отправил сегодня "Почтой России".