АвторТема: Компания Dante Labs  (Прочитано 36787 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5305
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2608/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #165 : 19 Ноябрь 2018, 21:03:15 »

А сложно ли написать программу, которая бы вырезала из БАМа только данные игрек хромосы?

Я абсолютный не специалист по генеалогическим файлам, месяца два назад узнал, что это такое за тесты, но как бывший программер предположу. что все они представляют из себя каким-то образом, упорядоченную базу данных. Значит эта манипуляция скорее всего будет несложной. Если только они специально не зашифрованы.
Это специфические бинарные архивы. Все ПО в основном под *NIX системы. Под Lunux или Mac - это пара строк с вызовом команд. Под Windows вроде портировали samtools, но подробностей не знаю.
Все это достаточно в принципе просто.

Оффлайн sommer

  • Сообщений: 246
  • Страна: ru
  • Рейтинг +69/-2
  • Y-ДНК: R1a-L664 S3485
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #166 : 19 Ноябрь 2018, 21:22:59 »
[Это специфические бинарные архивы. Все ПО в основном под *NIX системы. Под Lunux или Mac - это пара строк с вызовом команд. Под Windows вроде портировали samtools, но подробностей не знаю.
Все это достаточно в принципе просто.
А понятно.С бинарниками трохи посложней будет, бинарники используют видимо типа для экономии места (на самом деле ничего не экономят так как сжимают ряд цифр в ряд цифр, но это как всегда).

Оффлайн KetoDude

  • Сообщений: 15
  • Страна: us
  • Рейтинг +2/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #167 : 19 Ноябрь 2018, 21:34:17 »
Нужны добровольцы, кто может предоставить свои FASTQ файлы доктору Шаркову, для оценки качества секвенирования.

Свой Вам отдам. Не жалко.
Как получу результат, напишите, пожалуйста, как и куда отсылать.

:)
Спасибо огромное, Вам и всем остальным кто откликнется.  ;)
FASTQ нужно залить в облако и послать ссылку доктору Артему Шаркову на epileptologist (собака) list.ru

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34886
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3030/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #168 : 19 Ноябрь 2018, 21:58:25 »
FASTQ нужно залить в облако и послать ссылку доктору Артему Шаркову на epileptologist (собака) list.ru

Договорились. Потружусь для науки.   :)

Оффлайн kurganov4

  • Сообщений: 363
  • Страна: ru
  • Рейтинг +120/-0
  • Илья
    • деревня Рязанка Тамбовская область
  • Y-ДНК: R1a-M458 (YP1137)
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #169 : 20 Ноябрь 2018, 15:13:57 »
Тож заказал.

Оффлайн Ksenia365

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #170 : 20 Ноябрь 2018, 15:17:55 »
всем здравствуйте!
так и не поняла, кто нибудь заказывал напрямую в Россию без проблем?)
может кто ответит как заказать , не совсем поняла, доставка в Россию есть и переслать как? мож есть секреты?)
хочу по акции для ребенка, всем ответившим -спасибо.

Оффлайн Vital

  • Сообщений: 183
  • Страна: ru
  • Рейтинг +63/-0
  • FTDNA: 294252
  • Y-ДНК: R1a-M458>L1029>YP417>YP418>YP728>YP5079
  • мтДНК: V1a1c
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #171 : 20 Ноябрь 2018, 16:32:32 »
всем здравствуйте!
так и не поняла, кто нибудь заказывал напрямую в Россию без проблем?)
может кто ответит как заказать , не совсем поняла, доставка в Россию есть и переслать как? мож есть секреты?)
хочу по акции для ребенка, всем ответившим -спасибо.
Я заказывал в Россию. Через компанию - почтовый последник.
www.shipito.com   У них есть пересылочный хаб в Австрии.

Оффлайн Ksenia365

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #172 : 20 Ноябрь 2018, 16:46:40 »
Спасибо за ответ!
А обратно пересылали как? напрямую?
И в чем разница ,может что не понимаю, посредник  так же пришлет в Россию, или каким то определенным способом)\
Просто у Данте есть же доставка прямая в Россию.
Я спрашивала у Данте,мне ответили,что только юр.лицам, странно, что нужен будет tax ID.
но я как понимаю ,это для растаможки ИНН у физ лиц подошел бы
Т.е. имею ввиду что на физ лицо можно попробовать
Сложность может в том что пробирка для био материала,может просто попросить у Данте,чтобы указали что нить другое в описании))

Оффлайн Vital

  • Сообщений: 183
  • Страна: ru
  • Рейтинг +63/-0
  • FTDNA: 294252
  • Y-ДНК: R1a-M458>L1029>YP417>YP418>YP728>YP5079
  • мтДНК: V1a1c
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #173 : 20 Ноябрь 2018, 16:55:56 »
Обратно - да, напрямую в Dante Labs.

Когда я заказывал вроде бы не было пересылки напрямую в Россию. Поэтомы такие "костыли".
Хорошо, что сейчас этого уже не надо.

Оффлайн Ksenia365

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #174 : 20 Ноябрь 2018, 17:03:54 »
Обратно отправляли чем? DHL?
что указали в описании вложения?)

Оффлайн Vital

  • Сообщений: 183
  • Страна: ru
  • Рейтинг +63/-0
  • FTDNA: 294252
  • Y-ДНК: R1a-M458>L1029>YP417>YP418>YP728>YP5079
  • мтДНК: V1a1c
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #175 : 20 Ноябрь 2018, 17:21:40 »
Нет, не заморачивался.
Обычный малый пакет на Почте России. Описание : plastic tube.

Оффлайн Ksenia365

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #176 : 20 Ноябрь 2018, 17:31:28 »
спасибо)

Оффлайн Kote

  • Сообщений: 75
  • Страна: ru
  • Рейтинг +55/-0
  • I1–VISTULA
  • Y-ДНК: I1-Y6351+
  • мтДНК: H6a1a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #177 : 20 Ноябрь 2018, 17:58:39 »
Вот и я тоже решил примкнуть к группе энтузиастов, заказал 2шт. Изначально планировал брать BigY, но от такого интригующего предложения Dante Labs устоять не смог...) Перешел в режим ожидания. :)

Оффлайн KetoDude

  • Сообщений: 15
  • Страна: us
  • Рейтинг +2/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #178 : 20 Ноябрь 2018, 19:21:51 »
хочу по акции для ребенка, всем ответившим -спасибо.
если совсем маленькому ребенку, то у них есть вариант с swab kits - это когда палочкой с ваткой за щекой проводят.
из переписки с ними - "How old your children are? because we have also swab kit, maybe better for babies."

еще на забывайте, что FASTQ и BAM файлы присылают на жестком диске за дополнительные 59 Евро. :'(
https://www.dantelabs.com/products/500-gb-hard-disk-containing-your-raw-data

Оффлайн Ksenia365

  • Сообщений: 38
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #179 : 21 Ноябрь 2018, 09:45:07 »
Цитировать
если совсем маленькому ребенку, то у них есть вариант с swab kits - это когда палочкой с ваткой за щекой проводят.
из переписки с ними - "How old your children are? because we have also swab kit, maybe better for babies."

еще на забывайте, что FASTQ и BAM файлы присылают на жестком диске за дополнительные 59 Евро. :'(
https://www.dantelabs.com/products/500-gb-hard-disk-containing-your-raw-data

спасибо, не знала что есть такие варианты, ребенку 3г, плевать умеет ,видимо это уже обычный нужен комплект, спрошу дополнительно у Данте
про 59 евро  :'(
« Последнее редактирование: 21 Ноябрь 2018, 13:30:37 от пенелопа »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100