АвторТема: Компания Dante Labs  (Прочитано 168888 раз)

0 Пользователей и 3 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн Alexey_V.B.

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1305 : 25 Июнь 2021, 07:43:03 »
Как и ожидал, Dante Labs отказался переделать тест, ссылаясь на полученный результат FASTQ в сумме более 90 GBases.
Несколько попыток перемаппировать на Galaxy в hg38 ("Map with BWA-MEM") закончились неудачно с одинаковой ошибкой (один BAM в 26,4 вместо 40 GB):
error
An error occurred with this dataset:
[bwa_index] Pack FASTA... 34.82 sec
[bwa_index] Construct BWT for the packed sequence...
[BWTIncCreate] textLength=6211430126, available Word=449059136
[BWTIncConstructFromPacked] 10 iterations done. 99999998 characters processed.
[BWTIncConstructFromPack

Какие рекомендации по другому способу перемаппировать в домашних условиях (не требующего Linux)?
Есть еще вариант заказать за $25 в YSEQ, но не деньги ли это на ветер...

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 679
  • Страна: ru
  • Рейтинг +647/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1306 : 11 Июль 2021, 17:39:45 »
Свежий результат знакомого:



за полтора часа до процедуры сбора слюны чистил зубы  +  за 40 минут до процедуры был использован ополаскиватель Glister


Статы в YFull:






Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1240
  • Страна: ru
  • Рейтинг +912/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1307 : 11 Июль 2021, 18:40:46 »
Не плохо. Это с черной пятницы?

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 679
  • Страна: ru
  • Рейтинг +647/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1308 : 12 Июль 2021, 17:17:32 »
Да, но кит обратно в Италию только в мае добрался. Так что сделали быстро

В прошлом году было еще 2 кита, но там стата была похуже — где-то 75% mapped (тогда не знал о волшебной пользе ополаскивателей рта в этом деле)

Оффлайн SubbotaAnton

  • Сообщений: 303
  • Страна: ru
  • Рейтинг +211/-0
  • FTDNA: 594904, Gedmatch: T280867, Genbank MF278748
  • Y-ДНК: N-M231 L1027
  • мтДНК: I3d2
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1309 : 12 Июль 2021, 18:20:08 »
Да, но кит обратно в Италию только в мае добрался. Так что сделали быстро

В прошлом году было еще 2 кита, но там стата была похуже — где-то 75% mapped (тогда не знал о волшебной пользе ополаскивателей рта в этом деле)

Мой кит добрался до них в 20-х числах июня, пока висит в статусе "Awaiting Quality Control Inspection (QC)"

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1240
  • Страна: ru
  • Рейтинг +912/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1310 : 13 Июль 2021, 08:18:14 »
После подставы от Nebula я решил воздержаться от их услуг. Уж лучше Dante в Ноябре закупить. Либо Yseq если срочно. Со скоростью Yseq конечно никто не сравниться. Не надо ждать набор + до них доходит за 2 недели (макс 20 дней). Ну и стоимость набора для отправки всего 15 руб.

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1277
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1202/-2
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1311 : 18 Июль 2021, 12:41:33 »
Вероятно в DanteLabs грядут изменения. В группе Yfull на Facebook написано, что будет скоро больше информации.

Судя по изменению на их странице, где появился новый отдел Individuals, продажа тестов будет идти по другим сайтам. Похоже, что это будет https://www.stripe2be.com/

Также сообщение, https://www.globenewswire.com/en/news-release/2021/07/08/2259624/0/en/Dante-Labs-commits-to-ending-Rare-Disease-Odysseys-globally-through-Stripe2be-a-patient-centric-whole-genome-based-solution-tailored-for-rare-disease-patients.html

Цитировать
CAMBRIDGE, England, July 08, 2021 (GLOBE NEWSWIRE) -- Dante Labs, a leading genomics and diagnostics company, today announced the launch of Stripe2be, a platform and business unit fully dedicated to rare disease patients, offering personalized, AI-driven reports based on Whole Genome Sequencing and leveraging Dante Labs’ CE-IVD, ISO13485 certified Immensa Genomic Interpretation Software.

“I am excited to be part of the new Stripe2be team, where we provide people from all over the world with access to 100% of their own personal genetic data. Our WGS reports provide invaluable insight into - and the potential to improve - personal health; something that is especially important for those of us with a rare disease,” said Torie Robinson, Dante Labs Public Affairs & Patient Advocacy Manager for Stripe2be.

Цена теста на сайте 500€, выбор тот же 2 или 8 недель. В Гугле также всплывает Stripe2Be WGS 130X (8 Weeks), но страница отсутствует. В TOS на Stripe2be написано, что анализ будет в DanteLabs:
Цитировать
By ordering from the Website, you may purchase Dante Labs services which include the following:
- Analysis of your genotype generated by Dante Labs S.r.l. through the processing of your saliva sample provided for DNA extraction (“Genome Sequencing Test”). Dante Labs S.r.l. will perform the Genome Sequencing Test within 8 (eight) weeks from the receipt of your saliva sample.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1936
  • Страна: gb
  • Рейтинг +479/-4
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1312 : 18 Июль 2021, 14:40:23 »
Дантелабс у нас сейчас бабло косят пцр-тестами для несчастных отпускников, которых доят все кому не лень.

Оффлайн Club

  • Сообщений: 114
  • Страна: ru
  • Рейтинг +28/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1313 : 11 Август 2021, 23:05:42 »
Подскажите доставляет ли Dante Labs киты обычной почтой в РФ?

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1314 : 11 Август 2021, 23:12:27 »
Подскажите доставляет ли Dante Labs киты обычной почтой в РФ?

Нет, у них контракт с DHL, причем только на адреса юр. лиц.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5993
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4191/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1315 : 11 Август 2021, 23:24:08 »
Подскажите доставляет ли Dante Labs киты обычной почтой в РФ?

Нет, у них контракт с DHL, причем только на адреса юр. лиц.
А сейчас разве можно у них сделать заказ?

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1316 : 12 Август 2021, 00:54:38 »
Подскажите доставляет ли Dante Labs киты обычной почтой в РФ?

Нет, у них контракт с DHL, причем только на адреса юр. лиц.
А сейчас разве можно у них сделать заказ?

Хм, действительно: страничка https://www.dantelabs.com/collections/advanced-dna-tests не открывается  :-\

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5993
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4191/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1317 : 12 Август 2021, 01:04:21 »
Подскажите доставляет ли Dante Labs киты обычной почтой в РФ?

Нет, у них контракт с DHL, причем только на адреса юр. лиц.
А сейчас разве можно у них сделать заказ?
Хм, действительно: страничка https://www.dantelabs.com/collections/advanced-dna-tests не открывается  :-\
Они сменили бренд на персональное тестирование. Недавно рассылка была.Старые тесты принимают без проблем, протестировал на себе.
« Последнее редактирование: 12 Август 2021, 10:21:11 от Semargl »

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1277
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1202/-2
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1318 : 12 Август 2021, 07:25:55 »
На их странице есть ссылки на две другие: https://www.dantelabs.com/individuals/
Stripe2be и  Kurixhealth, в TOS написано, что анализ делает DanteLabs.
На первой странице тест дешевле, а сейчас еще и со скидкой. т.е. должно быть 250€.

Оффлайн Club

  • Сообщений: 114
  • Страна: ru
  • Рейтинг +28/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1319 : 12 Август 2021, 20:06:46 »
А эта Stripe2be тоже работает только с DHL( адрес юр. лиц)? Кто-нибудь пробовал заказывать в РФ киты у Stripe2be?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.