АвторТема: GEDmatch Genesis  (Прочитано 9067 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн ankr21Автор темы

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
GEDmatch Genesis
« : 22 Июнь 2017, 14:30:21 »
Давайте новую тему создадим.
Многие уже залили свои данные туда. https://genesis.gedmatch.com/login1.php
Количество матчей увеличилось за последние два дня. Проект состоялся, но есть косяки. Не у видел у себя в матчах родную матушку. Может что-то попутал когда загружал?
« Последнее редактирование: 05 Июнь 2018, 16:56:48 от ankr21 »

Оффлайн ankr21Автор темы

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #1 : 22 Июнь 2017, 14:32:32 »
Грузите туда Build 37 Consatenated. 36 не проходит.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #2 : 30 Июнь 2017, 10:20:22 »
А кто-то грузит b36?  ::) ;D
Я очень рад, что генезис пополняется данными.
Единственный вопрос - их туда реально нужно грузить по новой или те совпадения, которые там каждый день появляются новые, конвертируются из "старого" гедматча?

Оффлайн PZ

  • Сообщений: 47
  • Страна: ru
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: J-ZS6495
  • мтДНК: X2d1
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #3 : 11 Июль 2017, 23:49:42 »
А для "новеньких" есть смысл загружать данные в обычный Gedmatсh? И в чем принципиальное отличие этих систем, странно, если они на одном домене, но не дополнили функционал старой версии, а создали по сути новый сайт, наверное что-то кардинально должно было поменяться?

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #4 : 11 Июль 2017, 23:52:24 »
Кардинально поменяли алгоритмы.
Касательно "новеньких". Нужно грузиться пока что в оба. Почему? Потому что база совпаденцев и функций больше в "старом". А новый перспективнее.

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 132
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #5 : 18 Январь 2018, 18:02:46 »
А Genesis платный или нет?

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #6 : 19 Январь 2018, 23:17:22 »
Пока был бесплатным.
О планах сделать его платным мне неизвестно  :(

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 769
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #7 : 03 Март 2018, 12:20:46 »
В Генезисе нашёлся у меня совпаденец, который, по-видимому, тестировался в трёх лабораториях. В том числе сделал себе Whole Genome Test.
Подумал, может быть кому-то будет интересно сравнить.

Для человека, протеститрованного в 23andMe, он вот такой совпаденец.
KitNameLargest SegTotal cMGenOverlapDate ComparedTesting Company
ZP6643585Jukka Santala8.4640115.58816.54406422018-03-03Dante Labs Whole Genome
WT9811590Jukka Santala7.0137.0137.59064802018-03-0323andMeV3
AP1519283Jukka Santala8.0237922.21636.62505392018-03-03Genes for Good 1.2 tested 23andMe format

Для другого человека, протестированного в FTDNA, он вот такой совпаденец.

KitNameLargest SegTotal cMGenOverlapDate ComparedTesting Company
ZP6643585Jukka Santala9.26517.33285.63335192018-03-03Dante Labs Whole Genome
WT9811590Jukka Santala7.073214.13627.06625712018-03-0323andMeV3
AP1519283Jukka Santala7.91414.98727.02494072018-03-03Genes for Good 1.2 tested 23andMe format

Что характерно: чем больше Overlap, тем совпаденец менее совпаденец. Видимо небольшие отсутствующие в одном из образцов участки Gedmatch считает за одинаковые. Я думаю, когда мы все перейдём на полный геном, ложных совпаденцев станет меньше.


Оффлайн ankr21Автор темы

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #8 : 03 Март 2018, 12:38:04 »
Я когда-то очень давно состряпал табличку попарных сравнений результатов из разных лаб, которые хранятся в Генезисе. Цифры - количество снипов, учавствующие в сравнении. Может за пол года что-то изменилось. Проверять лениво. Привожу как было.


Оффлайн Temych

  • Сообщений: 8
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #9 : 17 Март 2018, 08:34:19 »
Помогите разобраться!
На сайте genesis.gedmatch.com были загружены мои данные. Тест сделан 23andMe. Сегодня зашёл и увидел новые результаты:
Largest Seg | Total cM | Gen |Overlap | Date Compared | Testing Company
11,61 | 197,97 | 3,10| 391012| 14.03.2018 |.Gencove
11,22 | 171,88 | 3,20| 390723| 14.03.2018 |.Gencove
12,81 | 135,39 | 3,40| 413628| 16.03.2018 |.Gencove
10,31 | 82,12 | 3,70| 417152| 14.03.2018 |.DNA Land
 
В тоже время смотрю результаты для Кита CE6851541https://genesis.gedmatch.com/v_OneToMany2.php?kit=CE6851541. У него количество Total cM от 1500 до 1000 - 430 раз, от 300 до 100 - 15800 раз!
Что это может значить или это какая-то ошибка в подсчётах? Можно ли доверять?


Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 399
  • Страна: ru
  • Рейтинг +199/-0
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #10 : 03 Апрель 2018, 15:06:41 »
Перенесли киты с основного сайта на Genesis

Оффлайн Feroce

  • Сообщений: 1907
  • Страна: ru
  • Рейтинг +608/-0
  • Потомок помещичьих крестьян Бессоновых(Безсоновых)
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP569>>Y11268>>>>Y86309/FT74365)
  • мтДНК: мтДНК в ожидании
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #11 : 03 Апрель 2018, 18:39:03 »
После последнего терминатора в голове так и сидит мысль, что генезис это скайнет, когда генезис запустится, настанет судный день, уничтожь скайнет до его рождения.  ;D  ;D

Оффлайн ankr21Автор темы

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #12 : 05 Июнь 2018, 16:50:10 »
Genesis новый столбец добавил: overlap.
Очень полезный, кстати. Видно сколько аллеей сравнивалось.
Но по прежнему gen дистанция неадыкватная отображается, как мне кажется.
« Последнее редактирование: 05 Июнь 2018, 17:36:04 от ankr21 »

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 399
  • Страна: ru
  • Рейтинг +199/-0
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #13 : 08 Июнь 2018, 03:48:28 »
Для калькулятора Eurogenes K13 заработал Rotating 3D-PCA

Оффлайн MaximN88

  • Сообщений: 108
  • Страна: ru
  • Рейтинг +9/-0
Re: GEDmatch Genesis
« Ответ #14 : 25 Июнь 2018, 07:31:48 »
Для калькулятора Eurogenes K13 заработал Rotating 3D-PCA

а как пользоваться этой штукой? Что такое pc1 pc2 ... pc9, и какие нужно выбирать?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.