АвторТема: что значит "генетическая дистанция" по ФТДНА?  (Прочитано 4425 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Evgeny Kolchugin

  • Сообщений: 376
  • Страна: ru
  • Рейтинг +105/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Цитировать
В теории да. На практике если у людей сильно разнятся уже первые панели, то дистанция скорее всего будет расти.
Спасибо. Практический вывод, что после 12 маркеров можно спокойно переходить к Биг-У и не тратить деньги на увеличение маркеров. Особенно, если и на первой панели совпаденцев немного.
« Последнее редактирование: 21 Июнь 2017, 00:39:28 от Evgeny Kolchugin »

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2205
  • Страна: ru
  • Рейтинг +481/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Цитировать
В теории да. На практике если у людей сильно разнятся уже первые панели, то дистанция скорее всего будет расти.
Спасибо. Пактический вывод, что после 12 маркеров можно спокойно переходить к Биг-У и не тратить деньги на увеличение маркеров. Особенно, если и на первой панели совпаденцев немного.
точно. YFull выдаст ещё порядка 400-420 СТР маркеров. Некоторые из 111 маркерной панели не причитаются, но их можно заменить модальными значениями и внести в базу Семаргл 111маркерный гаплотип.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Цитировать
В теории да. На практике если у людей сильно разнятся уже первые панели, то дистанция скорее всего будет расти.
Спасибо. Практический вывод, что после 12 маркеров можно спокойно переходить к Биг-У и не тратить деньги на увеличение маркеров. Особенно, если и на первой панели совпаденцев немного.
Тут есть проблема. Но она связана с особенностями отображения базы совпаденцев. Смотрите - условно у меня может быть y67 совпаденцев, который в базе не отображается как y25, просто потому что у него на y67 дельта вписывается в некие граничные значения, а т.к. все мутации на панели 25, там он уже вылезает за границы. Пример абстрактный. Но такая особенность в базе фтдна есть и я долго ломал голову, почему не бьются кол-ва совпаденцев по разным панелям (казалось бы, что оно должно *строго* уменьшаться при переходе от y12 через все промежуточные к y111)

Оффлайн Evgeny Kolchugin

  • Сообщений: 376
  • Страна: ru
  • Рейтинг +105/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Тут есть проблема. Но она связана с особенностями отображения базы совпаденцев. Смотрите - условно у меня может быть y67 совпаденцев, который в базе не отображается как y25, просто потому что у него на y67 дельта вписывается в некие граничные значения, а т.к. все мутации на панели 25, там он уже вылезает за границы.
Это ситуация, которую я и пытался обрисовать в своих вопросах. Но поскольку появление нового совпаденца при увеличении маркеров вещь маловероятная и практического значения для целей генеалогии не имеющая, подобный сценарий можно игнорировать. Да и, как выяснилось, все маркеры ФТДНА можно игнорировать вместе с их базой :D

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Цитировать
Но поскольку появление нового совпаденца при увеличении маркеров вещь маловероятная и практического значения для целей генеалогии не имеющая, подобный сценарий можно игнорировать.
не уверен.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11288
  • Страна: az
  • Рейтинг +2036/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Евгений, вы делаете поспешные выводы. Отсутствие совпадений на 12 маркёрах - вещь редкая. К этой категории относится и автор этих строк. БигИгрек не выявил новой ветви, т. к. банально не с кем её образовывать. Поэтому наличие совпаденцев имеет максимальную значимость. Если есть таковые на 67 маркёрах, то и дополнительные тесты уже не нужны. Из любви к искусству можно сделать снип-пак.
« Последнее редактирование: 21 Июнь 2017, 08:15:31 от Farroukh »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2365/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Цитировать
Практический вывод, что после 12 маркеров можно спокойно переходить к Биг-У и не тратить деньги на увеличение маркеров.

Меня вот уже давно такой вопрос интересует: YFull на 67-маркерной панели вытаскивает из BAMа STRы не во всех маркерах.

Как тогда быть с пробелами? Какие варианты:

1. Да и фиг с ними?

2. Ввести среднее арифметическое?

3. Заказать их отдельно у Томаса Крана?

« Последнее редактирование: 21 Июнь 2017, 08:24:24 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2365/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
но их можно заменить модальными значениями и внести в базу Семаргл 111маркерный гаплотип.

Когда важен каждый маркер, особенно в таких густонаселённых бангладешах, как некоторые субклады R1a, N1c и I2a1, вводить средние арифметические значения... По-моему это всё-таки не то пальто.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2365/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Но поскольку появление нового совпаденца при увеличении маркеров вещь маловероятная и практического значения для целей генеалогии не имеющая

А Вы хотели бы найти совпаденца по Y-линии в пределах генеалогического времени? Я на днях уже высказывал своё мнение по этому вопросу:

дело в том, что Ваши результаты сравнивать будут не со всем населением планеты Земля (если бы!), а с чуть меньше чем полностью - с базой FTDNA. Где-то есть отдельная тема, если найду, дам Вам ссылку, а может кто-то другой из форумчан поможет со ссылкой. Так вот, емнип, протестированных в FTDNA не набирается даже и одного процента от какого-либо народа. Поэтому Y используется больше для исторических целей, чем для генеалогических, потому что, даже если Вы попадёте в более представленную в FTDNA гаплогруппу, с более проработанным тестами деревом (то есть, представители которой могут себе позволить оплачивать зеленью тестирование в американской лаборатории), то ВБОП с ближайшими с Вами скорее всего и будет в пределах 1500 лет. И это усреднённо, без поправки на ветер (плюс-минус столько-то лет). Ну, разве что у Вас окажется какой-либо из британских R1b, и как следствие британские корни по мужской линии, т.к. оттуда наибольшая представленность в базе данных. или же арабский J1 по той же причине :)
« Последнее редактирование: 21 Июнь 2017, 08:25:16 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12300
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2365/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
все маркеры ФТДНА можно игнорировать вместе с их базой

В каком смысле?

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
все маркеры ФТДНА можно игнорировать вместе с их базой

В каком смысле?
Я так полагаю, что т.к. от них толку никакого )))) именно в ключе найти родственников в базе. Если самому их не тестировать.

Оффлайн Evgeny Kolchugin

  • Сообщений: 376
  • Страна: ru
  • Рейтинг +105/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Я так полагаю, что т.к. от них толку никакого )))) именно в ключе найти родственников в базе. Если самому их не тестировать.
Именно так. А для целенаправленного тестирования родственников, для предварительной оценки хватит и у12. А для точной оценки БигУ + YFull дадут лучший результат, чем у111.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11288
  • Страна: az
  • Рейтинг +2036/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Цитировать
для предварительной оценки хватит и у12. А для точной оценки БигУ + YFull дадут лучший результат, чем у111.
Евгений, это очень нерациональный (затратный) путь. Предположим Вы прошли тест на 12 маркёров и система выдала Вам 65458484512 совпаденцев. Делать им БигИгрек под силу лишь Гейтсу. Поэтому, чтобы оставить потенциальных родственников, нужно проапгрейдиться до 37, а ужепотом из тех кто есть выбрать ближайшего кандидата на БигИгрек.
« Последнее редактирование: 21 Июнь 2017, 15:37:43 от Farroukh »

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Farroukh и Evgeny Kolchugin
мне кажется, что вы друг друга не понимаете. Контекст потерян :-)

Цитировать
А для целенаправленного тестирования родственников, для предварительной оценки хватит и у12
если есть Вы и некий другой человек, то предварительно - да, достаточно Y12. (SNP сразу же в FTDNA ведь не заказать!!!!)
Если совпадет и известно, что есть общее родство по документам или семейным легендам, то будем считать, что оно предварительно подтверждается (хотя лучше уточнить).
Если есть разница - ну, видимо, не родственник.

Оффлайн Evgeny Kolchugin

  • Сообщений: 376
  • Страна: ru
  • Рейтинг +105/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Farroukh и Evgeny Kolchugin
мне кажется, что вы друг друга не понимаете. Контекст потерян :-)
Да, сильно от темы отклонились. Надо сворачивать)

Что касается "перескока" на БигУ, я имел в виду две ситуации:
1) использование у12 для предварительной проверки потенциальных родственников, выявленных по документам, среди однофамильцев. Там велика вероятность, что совпаденец по у12 совпадёт и дальше. Непосредственный переход к БигУ вполне оправдан. Это то, что описал gecube
2) Когда в базе ФТДНФ мало совпаденцев по у12. Вероятность сохранения совпадения или появление новых совпаденцев при возрастающем количестве маркеров ничтожна. Например, для образца 521730 по у12 - 91, по у25 - 14, а далее никого.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100