АвторТема: мт-ДНК - первые шаги  (Прочитано 2134 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SubbotaAntonАвтор темы

  • Сообщений: 303
  • Страна: ru
  • Рейтинг +211/-0
  • FTDNA: 594904, Gedmatch: T280867, Genbank MF278748
  • Y-ДНК: N-M231 L1027
  • мтДНК: I3d2
мт-ДНК - первые шаги
« : 07 Июнь 2017, 11:33:48 »
Добрый день!

На нашел, в какую тему удачно запихнуть мои вопросы по мт-ДНК. Возможно, правильнее создать эту тему - если нет, прошу переместить это куда следует :)

Итак, сегодня получены результаты по мт-ДНК на FTDNA. Включает в себя HVR1, HVR2 и CODING REGION .

А теперь вопросы:

1) На FTDNA гаплогруппа определенна как I3a , на 23andme в 2013 году определили как I3. Верить FTDNA?
2) Согласно калькулятору FTDNA, нет совпадений по трем и двум критериям, только по HVR1. Есть ли смысл изучать эти совпадения, или это слишком далеко?
3) По аналогии с gedmatch для аутосом - есть ли какой (какие) сайт для хранения мт-результатов? Хочется с большой базой и автоимпортом из FTDNA
4) На FTDNA есть результаты в двух форматах - RSRS и rCRS. Я слышал, второй сейчас популярнее, это верно?
5) По материнской линии я знаю предка примерно 1820 года рождения. Есть ли смысл искать кузенов от общего матриарха и просить сделать такой же тест? Даст ли это что-то в плане изучения родословной (вопрос в достоверности древа вроде бы не стоит)
6) Есть ли какое-то материнское древо по аналогии с тем, что строят на основе Y-Full?


Оффлайн Виталий77

  • Однодворец ищущий свои корни
  • Сообщений: 1544
  • Страна: ru
  • Рейтинг +491/-0
  • FTDNA: 297613
  • Y-ДНК: R1a-A7015
  • мтДНК: H13a1a1c
Re: мт-ДНК - первые шаги
« Ответ #1 : 07 Июнь 2017, 11:37:53 »

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 4079
  • Страна: rw
  • Рейтинг +1584/-8
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: мт-ДНК - первые шаги
« Ответ #2 : 07 Июнь 2017, 11:53:14 »
3) Генбанк: http://www.ianlogan.co.uk/checker/genbank.htm

Тут можно загрузиться и строить деревья с совпаденцами. (на первое и на второе где-то у нас висят инструкции).

6). http://www.phylotree.org/tree/index.htm

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 4079
  • Страна: rw
  • Рейтинг +1584/-8
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: мт-ДНК - первые шаги
« Ответ #3 : 07 Июнь 2017, 11:58:27 »
Цитировать
1) На FTDNA гаплогруппа определенна как I3a , на 23andme в 2013 году определили как I3. Верить FTDNA?

Да, FTDNA  точнее, тут есть полный сиквенс. А 23andme, скажем так, "недотипированный" результат.

Цитировать
2) Согласно калькулятору FTDNA, нет совпадений по трем и двум критериям, только по HVR1. Есть ли смысл изучать эти совпадения, или это слишком далеко?

по 2-3-м шагам тысячелетия

Цитировать
5) По материнской линии я знаю предка примерно 1820 года рождения. Есть ли смысл искать кузенов от общего матриарха и просить сделать такой же тест? Даст ли это что-то в плане изучения родословной (вопрос в достоверности древа вроде бы не стоит)

разве только для выверки

Оффлайн Елена Александровна

  • Сообщений: 2838
  • Страна: by
  • Рейтинг +800/-2
  • U5a1d2a1 Гедматч - M125805
  • Y-ДНК: R1a1a: отец 248308, сын 260304, дед по маме 249367
  • мтДНК: U5a1d2a1 - я; МЖМЖ U5
Re: мт-ДНК - первые шаги
« Ответ #4 : 07 Июнь 2017, 12:22:58 »
Согласна с Felix.
У меня на 23andMe всего U5a

Fullmt FTDNA дал  U5a1d2a
Сравнения дала на форуме молген
http://forum.vgd.ru/post/527/78087/p2434681.htm#pp2434681

Но уважаемой nmash уже и 23andMe дал более полную картину.
Тут как повезет.
Но мой случай - более частый.


Оффлайн Виталий77

  • Однодворец ищущий свои корни
  • Сообщений: 1544
  • Страна: ru
  • Рейтинг +491/-0
  • FTDNA: 297613
  • Y-ДНК: R1a-A7015
  • мтДНК: H13a1a1c
Re: мт-ДНК - первые шаги
« Ответ #5 : 07 Июнь 2017, 13:51:23 »
1) На FTDNA гаплогруппа определенна как I3a , на 23andme в 2013 году определили как I3. Верить FTDNA?
I3a: http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_group/i3_genbank_sequences.htm

Оффлайн SubbotaAntonАвтор темы

  • Сообщений: 303
  • Страна: ru
  • Рейтинг +211/-0
  • FTDNA: 594904, Gedmatch: T280867, Genbank MF278748
  • Y-ДНК: N-M231 L1027
  • мтДНК: I3d2
Re: мт-ДНК - первые шаги
« Ответ #6 : 07 Июнь 2017, 17:57:59 »
Спасибо всем за ответы!

В GenBank файл с мутациями  :) отправил, буду ждать, когда дадут еще один номерок.

В FTDNA вступил в группу по своей гаплогруппе, и кажется, сделал общественно-полезное дело - ведь мне написали, что (далее мой вольный перевод и оригинал)

"У вас замечательная выборка редких вариантов, из которых почти наверняка следует, что вы принадлежите к подгруппе I3a, которая еще не до конца идентифицирована. (Далее про варианты). В данным момент, исследователи получили доступ к данным по l3a из Эстонии, где есть все упомянутые маркеры кроме C486, а также есть один дополнительный вариант G7444A. Чтобы однозначно идентифицировать подгруппу, исследователям нужны новые и новые данные, похожие, но не совпадающие со упомянутыми маркерами. Ваш mtDNA - идеальный кандидат, чтобы помочь с идентификацией подгруппы".

Цитировать
You have a great set of rare variants, which strongly suggest that you belong to a subclade of I3a that has not yet been identified. These variants are: C456T, C486a, G3736A, T8260C, G9039A, and A15559G.  Currently, researchers have access to the data of one I3a sequence (from Estonia) with all of these markers except C486, and it has an extra variant G7444A.  In order to identify a subclade, researchers need to see several data sets that are similar (but not identical) with the relevant markers.  Your mtDNA is a perfect candidate to contribute evidence for your subclade.

PS В GenBank уже дали номер - MF278748

« Последнее редактирование: 07 Июнь 2017, 21:14:39 от SubbotaAnton »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.