АвторТема: Гаплогруппа DE  (Прочитано 32201 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1126
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1225/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #75 : 14 Июнь 2019, 18:07:50 »
Данные по африканским DE следует воспринимать с осторожностью. Это вполне могут оказаться данные конца 20 века с недотипированными E-M96.

Дотипировали:

https://www.genetics.org/content/early/2019/06/13/genetics.119.302368

A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa

Marc Haber, Abigail L. Jones, Bruce A. Connell, Asan, Elena Arciero, Huanming Yang, Mark G. Thomas, Yali Xue and Chris Tyler-Smith

Genetics Early online June 13, 2019; https://doi.org/10.1534/genetics.119.302368

Abstract

Present-day humans outside Africa descend mainly from a single expansion out ∼50,000-70,000 years ago, but many details of this expansion remain unclear, including the history of the male-specific Y chromosome at this time. Here, we re-investigate a rare deep-rooting African Y-chromosomal lineage by sequencing the whole genomes of three Nigerian men described in 2003 as carrying haplogroup DE* Y-chromosomes, and analyzing them in the context of a calibrated worldwide Y-chromosomal phylogeny. We confirm that these three chromosomes do represent a deep-rooting DE lineage, branching close to the DE bifurcation, but place them on the D branch as an outgroup to all other known D chromosomes, and designate the new lineage D0. We consider three models for the expansion of Y lineages out of Africa ∼50,000-100,000 years ago, incorporating migration back to Africa where necessary to explain present-day Y-lineage distributions. Considering both the Y-chromosomal phylogenetic structure incorporating the D0 lineage, and published evidence for modern humans outside Africa, the most favored model involves an origin of the DE lineage within Africa with D0 and E remaining there, and migration out of the three lineages (C, D and FT) that now form the vast majority of non-African Y chromosomes. The exit took place 50,300-81,000 years ago (latest date for FT lineage expansion outside Africa - earliest date for the D/D0 lineage split inside Africa), and most likely 50,300-59,400 years ago (considering Neanderthal admixture). This work resolves a long-running debate about Y-chromosomal out-of-Africa/back-to-Africa migrations, and provides insights into the out-of-Africa expansion more generally.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6354
  • Страна: ru
  • Рейтинг +816/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #76 : 14 Июнь 2019, 18:51:46 »
Выходит, что DE уже точно из Африки? И соответственно D вышли в Евразию?

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 555
  • Страна: aq
  • Рейтинг +87/-0
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #77 : 14 Июнь 2019, 19:09:43 »
Я с помощью гугл-переводчика понял только то, что это какая-то новая линия D0.
Мог бы кто-нибудь на простом русском написать, что же это всё означает?

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1126
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1225/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #78 : 14 Июнь 2019, 20:18:04 »
Я с помощью гугл-переводчика понял только то, что это какая-то новая линия D0.
Мог бы кто-нибудь на простом русском написать, что же это всё означает?

Современные люди за пределами Африки происходят в основном от единичного волны распространения ∼50,000-70,000 лет назад, но многие детали этой волны распространения остаются неясными, включая историю мужской специфической Y хромосомы в это время. Здесь мы вновь исследуем редкую африканскую Y-хромосомную линию с глубокими корнями, секвенировав целые геномы трех нигерийских мужчин, описанных в 2003 году как несущие гаплогруппу DE* Y-хромосомы, и анализируем их в контексте калиброванной по всему миру Y-хромосомной филогении. Мы подтверждаем, что эти три хромосомы действительно представляют собой глубоко укоренившуюся линию DE, ответвляющуюся вблизи разделения DE, но помещающую их на ветвь D в качестве внешней группы ко всем другим известным D хромосомам, и обозначает новую линию D0. Мы рассматриваем три модели распространения Y-хромосом за пределы Африки ∼50 000-100 000 лет назад, включая миграцию обратно в Африку, где это необходимо для объяснения современных распределений Y-хромосом. Учитывая как Y-хромосомную филогенетическую структуру, включающую линию D0, так и опубликованные данные для современных людей за пределами Африки, наиболее предпочтительной моделью является происхождение линии DE в Африке, где D0 и E остаются там, и миграция из трех линий (C, D и FT), которые сейчас составляют подавляющее большинство неафриканских Y-хромосом. Выход произошел 50,300-81,000 лет и, скорее всего, 50,300-59,400 лет назад (с учетом неандертальской примеси). Эта работа решает затянувшуюся проблему Y-хромосомной миграции за пределы Африки/назад в Африку и дает представление о миграции за пределы Африки в более общем плане.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11138
  • Страна: az
  • Рейтинг +1896/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #79 : 15 Июнь 2019, 05:52:05 »
Вывод прост: E-M96 из Африки не выходили. Это были D. Будем надеяться увидеть нигерийских ребят на древе Yfull :)

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 555
  • Страна: aq
  • Рейтинг +87/-0
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #80 : 15 Июнь 2019, 08:35:49 »
Выходит, что все представители гг DE, включая сирийца, относятся на самом деле к гг D, но их субклад выше снипа М174, поэтому он у них отрицательный.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1126
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1225/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #81 : 15 Июнь 2019, 08:37:50 »
Ну по хорошему надо всех DE (и другие неоднозначные образцы) перепроверить.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6232
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1095/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #82 : 15 Июнь 2019, 08:37:59 »
Supplemental Material for Haber et al., 2019

https://gsajournals.figshare.com/articles/Supplemental_Material_for_Haber_et_al_2019/8267861

Table S1. SNPs defining the D0 haplogroup
CHR POS REF ALT Ancestral Allele Haplogroup D0 Haplogroup D Haplogroup E Notes
Y 2668496 G T G T G G SNP on branch D0
Y 2684790 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 2746443 T G T G T T SNP on branch D0
Y 2759823 C A,G C G C C SNP on branch D0
Y 2763977 T C,G T G T T SNP on branch D0
Y 2774691 C T C T C C SNP on branch D0
Y 2794108 C G C G C C SNP on branch D0
Y 2824252 G A G A G G SNP on branch D0
Y 2848910 A G A G A A SNP on branch D0
Y 2850963 C T C T C C SNP on branch D0
Y 2853798 C A C A C C SNP on branch D0
Y 6676225 C T C T C C SNP on branch D0
Y 6708971 G A G A G G SNP on branch D0
Y 6721247 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 6747175 C T C T C C SNP on branch D0
Y 6747201 T A T A T T SNP on branch D0
Y 6753316 C A,G C G C C SNP on branch D0
Y 6797098 A G A G A A SNP on branch D0
Y 6821366 T C T C T T SNP on branch D0
Y 6831372 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 6868284 C G C G C C SNP on branch D0
Y 6889983 C T C T C C SNP on branch D0
Y 6893436 G A G A G G SNP on branch D0
Y 6895235 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 6917321 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 6941294 A T A T A A SNP on branch D0
Y 6949806 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7011465 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7034919 C A C A C C SNP on branch D0
Y 7079439 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7188219 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7210681 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7242606 G C G C G G SNP on branch D0
Y 7255622 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7265843 T C T C T T SNP on branch D0
Y 7270582 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7273551 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7277533 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7341810 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7347990 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 7378003 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7410122 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7570251 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7578738 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 7579824 G C G C G G SNP on branch D0
Y 7582262 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7620047 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7622045 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7678762 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7694383 A C A C A A SNP on branch D0
Y 7716819 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7774460 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7774466 A C A C A A SNP on branch D0
Y 7774495 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7801104 C G C G C C SNP on branch D0
Y 7851738 C G,T C G C C SNP on branch D0
Y 7876921 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7893690 C A C A C C SNP on branch D0
Y 7901352 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7929183 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7982853 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8016678 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8058955 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8060600 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8063190 G C,T G T G G SNP on branch D0
Y 8081026 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8088679 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8090376 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8095674 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8121376 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8155013 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8156277 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8174610 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8184538 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8200057 T C T C T T SNP on branch D0
Y 8226806 A G,T A T A A SNP on branch D0
Y 8227145 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 8240623 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 8254941 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8280068 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8310894 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8323918 G T G T G G SNP on branch D0
Y 8329083 T C T C T T SNP on branch D0
Y 8343705 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8356071 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8361702 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8364936 T C T C T T SNP on branch D0
Y 8372651 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8445499 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8465733 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8466101 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8467167 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8503452 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8538145 G T G T G G SNP on branch D0
Y 8575106 T A T A T T SNP on branch D0
Y 8584879 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8602076 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8691053 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8722220 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8793332 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8794276 T G T G T T SNP on branch D0
Y 8797330 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8824517 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 8839643 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8842697 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8856116 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8859409 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8901707 A T A T A A SNP on branch D0
Y 8989907 G C G C G G SNP on branch D0
Y 9017409 G C G C G G SNP on branch D0
Y 9025308 C A C A C C SNP on branch D0
Y 9037457 G A G A G G SNP on branch D0
Y 9038621 A G A G A A SNP on branch D0
Y 9143448 G A G A G G SNP on branch D0
Y 9393586 A G A G A A SNP on branch D0
Y 9446396 G C G C G G SNP on branch D0
Y 9799632 C G C G C C SNP on branch D0
Y 9806232 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 9832852 T A,C,G T G T T SNP on branch D0
Y 9836568 T G T G T T SNP on branch D0
Y 9869610 C T C T C C SNP on branch D0
Y 13888821 C T C T C C SNP on branch D0
Y 13930633 A C A C A A SNP on branch D0
Y 13992933 T G T G T T SNP on branch D0
Y 13994915 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14002365 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14003204 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14021992 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14053839 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14081375 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14097346 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14103822 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14109752 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14134168 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 14141253 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14179641 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14187102 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14194942 C A C A C C SNP on branch D0
Y 14208960 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14211461 A G A G A A SNP on branch D0
Y 14235752 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14237523 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14245933 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 14246908 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14248863 G T G T G G SNP on branch D0
Y 14257701 C G C G C C SNP on branch D0
Y 14260577 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14280476 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14288503 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14288505 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14305631 G C G C G G SNP on branch D0
Y 14312629 A G A G A A SNP on branch D0
Y 14318958 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14330845 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14374090 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14374809 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14399354 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14414388 G T G T G G SNP on branch D0
Y 14419460 G C,T G C G G SNP on branch D0
Y 14450770 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14500439 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14525419 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14585420 C G C G C C SNP on branch D0
Y 14609328 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 14666408 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14670529 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14719988 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14747047 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14749175 A G A G A A SNP on branch D0
Y 14779913 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14804607 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14871358 G T G T G G SNP on branch D0
Y 14880739 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14899954 G C G C G G SNP on branch D0
Y 14906414 C A C A C C SNP on branch D0
Y 14932294 T A T A T T SNP on branch D0
Y 14937914 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14939843 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14958661 T G T G T T SNP on branch D0
Y 14968252 G C G C G G SNP on branch D0
Y 14988080 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15008294 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 15027821 A C A C A A SNP on branch D0
Y 15091079 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15093392 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15134900 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 15156004 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15263809 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15267283 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15304575 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15329617 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15346240 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15359753 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15361848 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15386553 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15405581 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15407380 C G C G C C SNP on branch D0
Y 15409664 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15421012 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15430391 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15454212 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15485975 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15492613 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15556620 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15565074 C G C G C C SNP on branch D0
Y 15569204 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15573158 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15576256 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 15586075 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 15590430 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15606025 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15649155 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15650150 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 15650584 C G C G C C SNP on branch D0
Y 15654719 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15654720 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15720552 G T G T G G SNP on branch D0
Y 15728677 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15741085 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 15753305 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15759024 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15773171 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15813009 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15857645 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15877770 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 15904335 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15915838 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15919672 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15928533 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 15940113 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15949650 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15976108 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15995957 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15997967 C A,T C A C C SNP on branch D0
Y 16207875 T C T C T T SNP on branch D0
Y 16215815 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16247178 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16250850 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 16285874 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16304373 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 16312046 A G A G A A SNP on branch D0
Y 16351218 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16362847 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16398835 G C G C G G SNP on branch D0
Y 16428359 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16435213 A C A C A A SNP on branch D0
Y 16500555 A C A C A A SNP on branch D0
Y 16504575 T A T A T T SNP on branch D0
Y 16508626 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16547686 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16578892 A G A G A A SNP on branch D0
Y 16648170 A T A T A A SNP on branch D0
Y 16688265 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16756545 C A C A C C SNP on branch D0
Y 16766202 G T G T G G SNP on branch D0
Y 16790529 C A C A C C SNP on branch D0
Y 16801665 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 16835918 T G T G T T SNP on branch D0
Y 16852006 C A C A C C SNP on branch D0
Y 16874041 A T A T A A SNP on branch D0
Y 16929836 G T G T G G SNP on branch D0
Y 16972336 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 16975173 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16981686 G T G T G G SNP on branch D0
Y 16982518 T C T C T T SNP on branch D0
Y 16999327 A C A C A A SNP on branch D0
Y 17070326 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17098346 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17111150 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17131671 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17152734 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17221253 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17232821 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17238111 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17277598 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17300065 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 17323499 G C,T G C G G SNP on branch D0
Y 17372204 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17420429 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17426707 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17465843 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17496835 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 17530902 A C A C A A SNP on branch D0
Y 17546996 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17569596 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17572599 G C G C G G SNP on branch D0
Y 17583888 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17600941 T A T A T T SNP on branch D0
Y 17605224 C A C A C C SNP on branch D0
Y 17611578 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17612716 C A C A C C SNP on branch D0
Y 17616784 A C A C A A SNP on branch D0
Y 17625292 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17631594 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17635514 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17673481 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17708490 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 17713132 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 17730899 T A T A T T SNP on branch D0
Y 17774409 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17795962 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17837771 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17839512 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17840656 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17854404 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17871478 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17905232 C G C G C C SNP on branch D0
Y 17957591 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17963043 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17965193 A C A C A A SNP on branch D0
Y 18063984 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18066111 C G C G C C SNP on branch D0
Y 18096914 G C,T G C G G SNP on branch D0
Y 18101403 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18159807 C A C A C C SNP on branch D0
Y 18206875 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18211128 T C T C T T SNP on branch D0
Y 18254196 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18562963 T C T C T T SNP on branch D0
Y 18592596 G A G A G G SNP on branch D0
Y 18620031 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 18687010 C A C A C C SNP on branch D0
Y 18708674 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 18749926 T C T C T T SNP on branch D0
Y 18753056 G A G A G G SNP on branch D0
Y 18777364 A G A G A A SNP on branch D0
Y 18806613 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18889866 G T G T G G SNP on branch D0
Y 18911543 A G A G A A SNP on branch D0
Y 18964792 G C G C G G SNP on branch D0
Y 18966290 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19025196 A G A G A A SNP on branch D0
Y 19092442 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19133279 T C T C T T SNP on branch D0
Y 19134383 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19155428 G T G T G G SNP on branch D0
Y 19160994 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19209312 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19267189 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 19277949 T G T G T T SNP on branch D0
Y 19284117 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19328534 A T A T A A SNP on branch D0
Y 19367635 T G T G T T SNP on branch D0
Y 19411026 A G A G A A SNP on branch D0
Y 19424791 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19426445 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19437058 C A,G,T C T C C SNP on branch D0
Y 19438023 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19448656 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19495738 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19496243 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 19499938 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19501594 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19509942 C G,T C T C C SNP on branch D0
Y 19527979 C A C A C C SNP on branch D0
Y 19538674 T C T C T T SNP on branch D0
Y 21073079 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21082726 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21134961 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 21138948 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21143021 A C A C A A SNP on branch D0
Y 21143443 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 21250107 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21260548 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21263431 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21270765 T A T A T T SNP on branch D0
Y 21282240 T C T C T T SNP on branch D0
Y 21284949 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 21297607 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21318800 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21326964 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21353436 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21369802 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21379315 T G T G T T SNP on branch D0
Y 21447391 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21472585 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21472598 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21481057 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21491737 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21493978 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21537520 A C C A A A SNP on branch D0
Y 21539806 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 21545069 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21551016 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21555791 G C G C G G SNP on branch D0
Y 21559261 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21562163 A C A C A A SNP on branch D0
Y 21571786 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21579488 T C T C T T SNP on branch D0
Y 21626431 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21635462 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21674409 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21677887 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21686075 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21718932 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21738640 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21817774 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21862376 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21870701 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21888494 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21914507 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21963685 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21980440 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21991481 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22023057 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22066023 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22090416 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22091959 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 22095736 A C A C A A SNP on branch D0
Y 22204423 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22206482 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22545071 A C A C A A SNP on branch D0
Y 22554520 G T G T G G SNP on branch D0
Y 22570658 C G C G C C SNP on branch D0
Y 22656596 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22695457 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 22695458 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22713623 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 22741850 C G C G C C SNP on branch D0
Y 22762400 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22795562 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22828227 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22831056 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22834876 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22859408 G T G T G G SNP on branch D0
Y 22877026 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22891209 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22957062 T G T G T T SNP on branch D0
Y 22981592 G A G A G G SNP on branch D0
Y 22983357 A T A T A A SNP on branch D0
Y 22989279 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22989825 T G T G T T SNP on branch D0
Y 23021904 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23036719 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 23045034 T G T G T T SNP on branch D0
Y 23046699 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23056406 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23079345 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23089277 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23096248 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23098745 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23108446 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23111012 C A C A C C SNP on branch D0
Y 23122442 A T A T A A SNP on branch D0
Y 23124543 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23144492 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 23146811 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23154044 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23155355 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23273837 C G C G C C SNP on branch D0
Y 23292618 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23348356 T C,G T G T T SNP on branch D0
Y 23350698 T C T C T T SNP on branch D0
Y 23369345 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23377470 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23382836 C A C A C C SNP on branch D0
Y 23436143 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 23441139 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23450248 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23462529 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23499910 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23504298 A T A T A A SNP on branch D0
Y 23523496 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23575674 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23583903 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 23594139 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23749105 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 23758375 C G C G C C SNP on branch D0
Y 23761946 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23797822 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 23849932 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23852103 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23857560 A C A C A A SNP on branch D0
Y 23860258 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23872967 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23968194 C T C T C C SNP on branch D0
Y 24459882 A G A G A A SNP on branch D0
Y 28604656 G C G C G G SNP on branch D0
Y 28615774 G T G T G G SNP on branch D0
Y 28639397 T C T C T T SNP on branch D0
Y 28654892 G A G A G G SNP on branch D0
Y 28655745 T C T C T T SNP on branch D0
Y 28676222 G A G A G G SNP on branch D0
Y 28705352 C T C T C C SNP on branch D0
Y 28731389 G A G A G G SNP on branch D0
Y 28741469 C T C T C C SNP on branch D0
Y 28747656 T A T A T T SNP on branch D0
Y 28750611 T A,G T A T T SNP on branch D0
Y 28761112 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8685674 C T C T C C SNP on branch D0 recurs elsewhere (C1b2a)
Y 2708779 A C,G A G A A SNP on branch D0 recurs elsewhere (F2)
Y 23554761 A C A C A C SNP on branch D0 recurs on E (or back mutation on D)
Y 15281995 G A G A A G SNP on branch D0|D
Y 15343571 T C T C C T SNP on branch D0|D
Y 15343575 T G T G G T SNP on branch D0|D
Y 17545328 C T C T T C SNP on branch D0|D
Y 17839184 C T C T T C SNP on branch D0|D
Y 19025435 A T A T T A SNP on branch D0|D
Y 23286394 T C T C C T SNP on branch D0|D
Y 2728927 A G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 6931590 T A,C,G T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 7169899 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 7320623 G A G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 7332132 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 7540450 A G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 8072664 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 8816007 T G T G G G SNP on branch D0|D|E
Y 9142309 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 9851457 G T G T T T SNP on branch D0|D|E
Y 14842223 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 15543875 C A,G,T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 15590674 T A T A A A SNP on branch D0|D|E
Y 15591537 G A,C,T G C C C SNP on branch D0|D|E
Y 17011456 G A,T G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 18561042 T G T G G G SNP on branch D0|D|E
Y 18907927 A G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 19338287 T C T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 19370916 G A G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 21227423 G T G T T T SNP on branch D0|D|E
Y 21306315 G A G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 21398584 T A,G T A A A SNP on branch D0|D|E
Y 21458735 A G,T A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 21582351 A C,G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 21717208 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 22014732 C A,G C G G G SNP on branch D0|D|E
Y 22721522 T C T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 23109543 T C,G T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 24392653 C G C G G G SNP on branch D0|D|E



Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6232
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1095/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #83 : 15 Июнь 2019, 08:39:28 »
Вывод прост: E-M96 из Африки не выходили. Это были D. Будем надеяться увидеть нигерийских ребят на древе Yfull :)

Пока не увидел ссылки на BAM.
Кто увидит первым - транслируйте в YFull.

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 555
  • Страна: aq
  • Рейтинг +87/-0
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #84 : 15 Июнь 2019, 10:51:35 »
У нас в данный момент только одна реальная возможность получить результаты сирийца на YFULL. С результатами нигерийцев шансов нет.

Оффлайн ДАР_ИСИДЫ

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 392
  • Страна: 00
  • Рейтинг +18/-1
  • Сидоров Сергей
  • Y-ДНК: N-P43-Y3185?-FGC38830?? ~2000 TMRCA with L665 391=11 458=15 12 23 13 11 11 12 11 12 10 13 12 31 15 9 9 11 12 28 14 18 27 13 14 16 - 11 11 18 19 15 14 17 17 33 39 12 10
  • мтДНК: H132
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #85 : 15 Июнь 2019, 13:38:25 »
Я правильно понимаю, что из 196 снипов, кодирующих гаплогруппу D на YFull , у D0 есть только 7 штук?

Supplemental Material for Haber et al., 2019

https://gsajournals.figshare.com/articles/Supplemental_Material_for_Haber_et_al_2019/8267861

Table S1. SNPs defining the D0 haplogroup
CHR POS REF ALT Ancestral Allele Haplogroup D0 Haplogroup D Haplogroup E Notes
Y 2668496 G T G T G G SNP on branch D0
Y 2684790 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 2746443 T G T G T T SNP on branch D0
Y 2759823 C A,G C G C C SNP on branch D0
Y 2763977 T C,G T G T T SNP on branch D0
Y 2774691 C T C T C C SNP on branch D0
Y 2794108 C G C G C C SNP on branch D0
Y 2824252 G A G A G G SNP on branch D0
Y 2848910 A G A G A A SNP on branch D0
Y 2850963 C T C T C C SNP on branch D0
Y 2853798 C A C A C C SNP on branch D0
Y 6676225 C T C T C C SNP on branch D0
Y 6708971 G A G A G G SNP on branch D0
Y 6721247 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 6747175 C T C T C C SNP on branch D0
Y 6747201 T A T A T T SNP on branch D0
Y 6753316 C A,G C G C C SNP on branch D0
Y 6797098 A G A G A A SNP on branch D0
Y 6821366 T C T C T T SNP on branch D0
Y 6831372 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 6868284 C G C G C C SNP on branch D0
Y 6889983 C T C T C C SNP on branch D0
Y 6893436 G A G A G G SNP on branch D0
Y 6895235 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 6917321 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 6941294 A T A T A A SNP on branch D0
Y 6949806 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7011465 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7034919 C A C A C C SNP on branch D0
Y 7079439 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7188219 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7210681 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7242606 G C G C G G SNP on branch D0
Y 7255622 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7265843 T C T C T T SNP on branch D0
Y 7270582 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7273551 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7277533 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7341810 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7347990 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 7378003 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7410122 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7570251 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7578738 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 7579824 G C G C G G SNP on branch D0
Y 7582262 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7620047 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7622045 C T C T C C SNP on branch D0
Y 7678762 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7694383 A C A C A A SNP on branch D0
Y 7716819 A T A T A A SNP on branch D0
Y 7774460 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7774466 A C A C A A SNP on branch D0
Y 7774495 G A G A G G SNP on branch D0
Y 7801104 C G C G C C SNP on branch D0
Y 7851738 C G,T C G C C SNP on branch D0
Y 7876921 A G A G A A SNP on branch D0
Y 7893690 C A C A C C SNP on branch D0
Y 7901352 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7929183 G T G T G G SNP on branch D0
Y 7982853 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8016678 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8058955 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8060600 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8063190 G C,T G T G G SNP on branch D0
Y 8081026 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8088679 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8090376 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8095674 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8121376 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8155013 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8156277 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8174610 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8184538 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8200057 T C T C T T SNP on branch D0
Y 8226806 A G,T A T A A SNP on branch D0
Y 8227145 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 8240623 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 8254941 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8280068 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8310894 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8323918 G T G T G G SNP on branch D0
Y 8329083 T C T C T T SNP on branch D0
Y 8343705 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8356071 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8361702 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8364936 T C T C T T SNP on branch D0
Y 8372651 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8445499 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8465733 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8466101 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8467167 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8503452 C G C G C C SNP on branch D0
Y 8538145 G T G T G G SNP on branch D0
Y 8575106 T A T A T T SNP on branch D0
Y 8584879 A G A G A A SNP on branch D0
Y 8602076 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8691053 A C A C A A SNP on branch D0
Y 8722220 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8793332 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8794276 T G T G T T SNP on branch D0
Y 8797330 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8824517 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 8839643 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8842697 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8856116 C T C T C C SNP on branch D0
Y 8859409 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8901707 A T A T A A SNP on branch D0
Y 8989907 G C G C G G SNP on branch D0
Y 9017409 G C G C G G SNP on branch D0
Y 9025308 C A C A C C SNP on branch D0
Y 9037457 G A G A G G SNP on branch D0
Y 9038621 A G A G A A SNP on branch D0
Y 9143448 G A G A G G SNP on branch D0
Y 9393586 A G A G A A SNP on branch D0
Y 9446396 G C G C G G SNP on branch D0
Y 9799632 C G C G C C SNP on branch D0
Y 9806232 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 9832852 T A,C,G T G T T SNP on branch D0
Y 9836568 T G T G T T SNP on branch D0
Y 9869610 C T C T C C SNP on branch D0
Y 13888821 C T C T C C SNP on branch D0
Y 13930633 A C A C A A SNP on branch D0
Y 13992933 T G T G T T SNP on branch D0
Y 13994915 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14002365 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14003204 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14021992 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14053839 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14081375 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14097346 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14103822 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14109752 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14134168 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 14141253 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14179641 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14187102 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14194942 C A C A C C SNP on branch D0
Y 14208960 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14211461 A G A G A A SNP on branch D0
Y 14235752 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14237523 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14245933 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 14246908 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14248863 G T G T G G SNP on branch D0
Y 14257701 C G C G C C SNP on branch D0
Y 14260577 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14280476 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14288503 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14288505 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14305631 G C G C G G SNP on branch D0
Y 14312629 A G A G A A SNP on branch D0
Y 14318958 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14330845 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14374090 A T A T A A SNP on branch D0
Y 14374809 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14399354 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14414388 G T G T G G SNP on branch D0
Y 14419460 G C,T G C G G SNP on branch D0
Y 14450770 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14500439 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14525419 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14585420 C G C G C C SNP on branch D0
Y 14609328 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 14666408 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14670529 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14719988 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14747047 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14749175 A G A G A A SNP on branch D0
Y 14779913 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14804607 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14871358 G T G T G G SNP on branch D0
Y 14880739 G A G A G G SNP on branch D0
Y 14899954 G C G C G G SNP on branch D0
Y 14906414 C A C A C C SNP on branch D0
Y 14932294 T A T A T T SNP on branch D0
Y 14937914 T C T C T T SNP on branch D0
Y 14939843 C T C T C C SNP on branch D0
Y 14958661 T G T G T T SNP on branch D0
Y 14968252 G C G C G G SNP on branch D0
Y 14988080 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15008294 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 15027821 A C A C A A SNP on branch D0
Y 15091079 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15093392 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15134900 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 15156004 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15263809 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15267283 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15304575 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15329617 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15346240 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15359753 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15361848 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15386553 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15405581 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15407380 C G C G C C SNP on branch D0
Y 15409664 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15421012 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15430391 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15454212 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15485975 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15492613 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15556620 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15565074 C G C G C C SNP on branch D0
Y 15569204 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15573158 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15576256 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 15586075 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 15590430 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15606025 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15649155 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15650150 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 15650584 C G C G C C SNP on branch D0
Y 15654719 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15654720 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15720552 G T G T G G SNP on branch D0
Y 15728677 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15741085 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 15753305 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15759024 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15773171 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15813009 C A C A C C SNP on branch D0
Y 15857645 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15877770 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 15904335 A G A G A A SNP on branch D0
Y 15915838 G A G A G G SNP on branch D0
Y 15919672 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15928533 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 15940113 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15949650 T C T C T T SNP on branch D0
Y 15976108 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15995957 C T C T C C SNP on branch D0
Y 15997967 C A,T C A C C SNP on branch D0
Y 16207875 T C T C T T SNP on branch D0
Y 16215815 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16247178 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16250850 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 16285874 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16304373 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 16312046 A G A G A A SNP on branch D0
Y 16351218 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16362847 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16398835 G C G C G G SNP on branch D0
Y 16428359 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16435213 A C A C A A SNP on branch D0
Y 16500555 A C A C A A SNP on branch D0
Y 16504575 T A T A T T SNP on branch D0
Y 16508626 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16547686 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16578892 A G A G A A SNP on branch D0
Y 16648170 A T A T A A SNP on branch D0
Y 16688265 G A G A G G SNP on branch D0
Y 16756545 C A C A C C SNP on branch D0
Y 16766202 G T G T G G SNP on branch D0
Y 16790529 C A C A C C SNP on branch D0
Y 16801665 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 16835918 T G T G T T SNP on branch D0
Y 16852006 C A C A C C SNP on branch D0
Y 16874041 A T A T A A SNP on branch D0
Y 16929836 G T G T G G SNP on branch D0
Y 16972336 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 16975173 C T C T C C SNP on branch D0
Y 16981686 G T G T G G SNP on branch D0
Y 16982518 T C T C T T SNP on branch D0
Y 16999327 A C A C A A SNP on branch D0
Y 17070326 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17098346 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17111150 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17131671 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17152734 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17221253 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17232821 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17238111 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17277598 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17300065 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 17323499 G C,T G C G G SNP on branch D0
Y 17372204 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17420429 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17426707 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17465843 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17496835 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 17530902 A C A C A A SNP on branch D0
Y 17546996 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17569596 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17572599 G C G C G G SNP on branch D0
Y 17583888 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17600941 T A T A T T SNP on branch D0
Y 17605224 C A C A C C SNP on branch D0
Y 17611578 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17612716 C A C A C C SNP on branch D0
Y 17616784 A C A C A A SNP on branch D0
Y 17625292 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17631594 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17635514 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17673481 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17708490 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 17713132 T A,C T C T T SNP on branch D0
Y 17730899 T A T A T T SNP on branch D0
Y 17774409 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17795962 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17837771 C T C T C C SNP on branch D0
Y 17839512 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17840656 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17854404 G A G A G G SNP on branch D0
Y 17871478 A G A G A A SNP on branch D0
Y 17905232 C G C G C C SNP on branch D0
Y 17957591 T C T C T T SNP on branch D0
Y 17963043 G T G T G G SNP on branch D0
Y 17965193 A C A C A A SNP on branch D0
Y 18063984 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18066111 C G C G C C SNP on branch D0
Y 18096914 G C,T G C G G SNP on branch D0
Y 18101403 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18159807 C A C A C C SNP on branch D0
Y 18206875 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18211128 T C T C T T SNP on branch D0
Y 18254196 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18562963 T C T C T T SNP on branch D0
Y 18592596 G A G A G G SNP on branch D0
Y 18620031 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 18687010 C A C A C C SNP on branch D0
Y 18708674 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 18749926 T C T C T T SNP on branch D0
Y 18753056 G A G A G G SNP on branch D0
Y 18777364 A G A G A A SNP on branch D0
Y 18806613 C T C T C C SNP on branch D0
Y 18889866 G T G T G G SNP on branch D0
Y 18911543 A G A G A A SNP on branch D0
Y 18964792 G C G C G G SNP on branch D0
Y 18966290 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19025196 A G A G A A SNP on branch D0
Y 19092442 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19133279 T C T C T T SNP on branch D0
Y 19134383 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19155428 G T G T G G SNP on branch D0
Y 19160994 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19209312 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19267189 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 19277949 T G T G T T SNP on branch D0
Y 19284117 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19328534 A T A T A A SNP on branch D0
Y 19367635 T G T G T T SNP on branch D0
Y 19411026 A G A G A A SNP on branch D0
Y 19424791 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19426445 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19437058 C A,G,T C T C C SNP on branch D0
Y 19438023 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19448656 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19495738 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19496243 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 19499938 G A G A G G SNP on branch D0
Y 19501594 C T C T C C SNP on branch D0
Y 19509942 C G,T C T C C SNP on branch D0
Y 19527979 C A C A C C SNP on branch D0
Y 19538674 T C T C T T SNP on branch D0
Y 21073079 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21082726 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21134961 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 21138948 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21143021 A C A C A A SNP on branch D0
Y 21143443 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 21250107 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21260548 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21263431 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21270765 T A T A T T SNP on branch D0
Y 21282240 T C T C T T SNP on branch D0
Y 21284949 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 21297607 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21318800 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21326964 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21353436 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21369802 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21379315 T G T G T T SNP on branch D0
Y 21447391 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21472585 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21472598 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21481057 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21491737 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21493978 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21537520 A C C A A A SNP on branch D0
Y 21539806 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 21545069 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21551016 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21555791 G C G C G G SNP on branch D0
Y 21559261 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21562163 A C A C A A SNP on branch D0
Y 21571786 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21579488 T C T C T T SNP on branch D0
Y 21626431 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21635462 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21674409 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21677887 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21686075 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21718932 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21738640 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21817774 G T G T G G SNP on branch D0
Y 21862376 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21870701 A G A G A A SNP on branch D0
Y 21888494 G A G A G G SNP on branch D0
Y 21914507 C T C T C C SNP on branch D0
Y 21963685 C A C A C C SNP on branch D0
Y 21980440 A T A T A A SNP on branch D0
Y 21991481 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22023057 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22066023 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22090416 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22091959 A C,G A G A A SNP on branch D0
Y 22095736 A C A C A A SNP on branch D0
Y 22204423 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22206482 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22545071 A C A C A A SNP on branch D0
Y 22554520 G T G T G G SNP on branch D0
Y 22570658 C G C G C C SNP on branch D0
Y 22656596 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22695457 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 22695458 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22713623 G A,C G A G G SNP on branch D0
Y 22741850 C G C G C C SNP on branch D0
Y 22762400 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22795562 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22828227 C A C A C C SNP on branch D0
Y 22831056 C T C T C C SNP on branch D0
Y 22834876 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22859408 G T G T G G SNP on branch D0
Y 22877026 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22891209 A G A G A A SNP on branch D0
Y 22957062 T G T G T T SNP on branch D0
Y 22981592 G A G A G G SNP on branch D0
Y 22983357 A T A T A A SNP on branch D0
Y 22989279 T C T C T T SNP on branch D0
Y 22989825 T G T G T T SNP on branch D0
Y 23021904 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23036719 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 23045034 T G T G T T SNP on branch D0
Y 23046699 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23056406 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23079345 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23089277 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23096248 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23098745 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23108446 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23111012 C A C A C C SNP on branch D0
Y 23122442 A T A T A A SNP on branch D0
Y 23124543 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23144492 G A,T G A G G SNP on branch D0
Y 23146811 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23154044 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23155355 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23273837 C G C G C C SNP on branch D0
Y 23292618 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23348356 T C,G T G T T SNP on branch D0
Y 23350698 T C T C T T SNP on branch D0
Y 23369345 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23377470 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23382836 C A C A C C SNP on branch D0
Y 23436143 A C,T A T A A SNP on branch D0
Y 23441139 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23450248 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23462529 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23499910 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23504298 A T A T A A SNP on branch D0
Y 23523496 G C G C G G SNP on branch D0
Y 23575674 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23583903 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 23594139 C T C T C C SNP on branch D0
Y 23749105 T C,G T C T T SNP on branch D0
Y 23758375 C G C G C C SNP on branch D0
Y 23761946 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23797822 C A,T C T C C SNP on branch D0
Y 23849932 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23852103 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23857560 A C A C A A SNP on branch D0
Y 23860258 A G A G A A SNP on branch D0
Y 23872967 G A G A G G SNP on branch D0
Y 23968194 C T C T C C SNP on branch D0
Y 24459882 A G A G A A SNP on branch D0
Y 28604656 G C G C G G SNP on branch D0
Y 28615774 G T G T G G SNP on branch D0
Y 28639397 T C T C T T SNP on branch D0
Y 28654892 G A G A G G SNP on branch D0
Y 28655745 T C T C T T SNP on branch D0
Y 28676222 G A G A G G SNP on branch D0
Y 28705352 C T C T C C SNP on branch D0
Y 28731389 G A G A G G SNP on branch D0
Y 28741469 C T C T C C SNP on branch D0
Y 28747656 T A T A T T SNP on branch D0
Y 28750611 T A,G T A T T SNP on branch D0
Y 28761112 G A G A G G SNP on branch D0
Y 8685674 C T C T C C SNP on branch D0 recurs elsewhere (C1b2a)
Y 2708779 A C,G A G A A SNP on branch D0 recurs elsewhere (F2)
Y 23554761 A C A C A C SNP on branch D0 recurs on E (or back mutation on D)
Y 15281995 G A G A A G SNP on branch D0|D
Y 15343571 T C T C C T SNP on branch D0|D
Y 15343575 T G T G G T SNP on branch D0|D
Y 17545328 C T C T T C SNP on branch D0|D
Y 17839184 C T C T T C SNP on branch D0|D
Y 19025435 A T A T T A SNP on branch D0|D
Y 23286394 T C T C C T SNP on branch D0|D
Y 2728927 A G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 6931590 T A,C,G T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 7169899 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 7320623 G A G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 7332132 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 7540450 A G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 8072664 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 8816007 T G T G G G SNP on branch D0|D|E
Y 9142309 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 9851457 G T G T T T SNP on branch D0|D|E
Y 14842223 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 15543875 C A,G,T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 15590674 T A T A A A SNP on branch D0|D|E
Y 15591537 G A,C,T G C C C SNP on branch D0|D|E
Y 17011456 G A,T G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 18561042 T G T G G G SNP on branch D0|D|E
Y 18907927 A G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 19338287 T C T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 19370916 G A G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 21227423 G T G T T T SNP on branch D0|D|E
Y 21306315 G A G A A A SNP on branch D0|D|E
Y 21398584 T A,G T A A A SNP on branch D0|D|E
Y 21458735 A G,T A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 21582351 A C,G A G G G SNP on branch D0|D|E
Y 21717208 C T C T T T SNP on branch D0|D|E
Y 22014732 C A,G C G G G SNP on branch D0|D|E
Y 22721522 T C T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 23109543 T C,G T C C C SNP on branch D0|D|E
Y 24392653 C G C G G G SNP on branch D0|D|E



Оффлайн ДАР_ИСИДЫ

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 392
  • Страна: 00
  • Рейтинг +18/-1
  • Сидоров Сергей
  • Y-ДНК: N-P43-Y3185?-FGC38830?? ~2000 TMRCA with L665 391=11 458=15 12 23 13 11 11 12 11 12 10 13 12 31 15 9 9 11 12 28 14 18 27 13 14 16 - 11 11 18 19 15 14 17 17 33 39 12 10
  • мтДНК: H132
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #86 : 15 Июнь 2019, 13:50:25 »

FamilyTreeDNA подарила ему BigY-700, срок - конец мая.
В проект гаплогруппы D тоже вступил.

Сатоши пишет, что BigY-700 сделали, но результатов нет, даже БАМ скачать нельзя. В общем, опять цирк с результатами теста.
Нам придётся долго ждать, пока появяться результаты теста и место на древе гг DE :(

А я не могу ничего с этим поделать? Получается, на YFull добавить невозможно?

Оффлайн ДАР_ИСИДЫ

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 392
  • Страна: 00
  • Рейтинг +18/-1
  • Сидоров Сергей
  • Y-ДНК: N-P43-Y3185?-FGC38830?? ~2000 TMRCA with L665 391=11 458=15 12 23 13 11 11 12 11 12 10 13 12 31 15 9 9 11 12 28 14 18 27 13 14 16 - 11 11 18 19 15 14 17 17 33 39 12 10
  • мтДНК: H132
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #87 : 15 Июнь 2019, 14:43:18 »

FamilyTreeDNA подарила ему BigY-700, срок - конец мая.
В проект гаплогруппы D тоже вступил.

Сатоши пишет, что BigY-700 сделали, но результатов нет, даже БАМ скачать нельзя. В общем, опять цирк с результатами теста.
Нам придётся долго ждать, пока появяться результаты теста и место на древе гг DE :(

А CSV не подойдёт?

Оффлайн ДАР_ИСИДЫ

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 392
  • Страна: 00
  • Рейтинг +18/-1
  • Сидоров Сергей
  • Y-ДНК: N-P43-Y3185?-FGC38830?? ~2000 TMRCA with L665 391=11 458=15 12 23 13 11 11 12 11 12 10 13 12 31 15 9 9 11 12 28 14 18 27 13 14 16 - 11 11 18 19 15 14 17 17 33 39 12 10
  • мтДНК: H132
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #88 : 15 Июнь 2019, 15:33:29 »
Вывод прост: E-M96 из Африки не выходили. Это были D. Будем надеяться увидеть нигерийских ребят на древе Yfull :)

https://gsajournals.figshare.com/ndownloader/files/15459056 Вы видели гаплотипы этих африканских D0 ? Там жуткое однообразие - всего 2500 лет по их расчётам между нигерийскими. Если это правильный подсчёт возраста, то с гвинейскими по моим подсчётам будет меньше 5000, а с ближневосточными специалисты могут лучше меня посчитать https://www.familytreedna.com/public/sidoroff?iframe=ycolorized , и ближневосточные столь же разнообразны между собой, как они сами с африканскими. Жаль, что авторы статьи делают столь далекоидущие выводы, при том, что на момент выхода статьи у FTDNA уже неделю существовал результат моего брата. А чудовищную молодость нигерийских D0 они сами подтвердили своими расчётами.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6232
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1095/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа DE
« Ответ #89 : 15 Июнь 2019, 15:55:10 »
Вывод прост: E-M96 из Африки не выходили. Это были D. Будем надеяться увидеть нигерийских ребят на древе Yfull :)

https://gsajournals.figshare.com/ndownloader/files/15459056 Вы видели гаплотипы этих африканских D0 ? Там жуткое однообразие - всего 2500 лет по их расчётам между нигерийскими. Если это правильный подсчёт возраста, то с гвинейскими по моим подсчётам будет меньше 5000, а с ближневосточными специалисты могут лучше меня посчитать https://www.familytreedna.com/public/sidoroff?iframe=ycolorized , и ближневосточные столь же разнообразны между собой, как они сами с африканскими. Жаль, что авторы статьи делают столь далекоидущие выводы, при том, что на момент выхода статьи у FTDNA уже неделю существовал результат моего брата. А чудовищную молодость нигерийских D0 они сами подтвердили своими расчётами.


Table S2. Split-time estimates using the ρ statistic
95% CI‡
Haplogroup 1† Haplogroup 2 T (kya) Lower Upper
AB CT 101,1 89,4 114,7
DE CF 76,5 67,6 86,7
C F 76,0 67,2 86,2
D0|D E 73,2 64,7 83,0
D0 D 71,4 63,1 81,0
Nigerian-1|Nigerian-2 Nigerian-3 2,5 2,2 2,8
Nigerian-1 Nigerian-2 1,9 1,7 2,2
E1 E2 58,9 52,1 66,8
E1b1a E1b1b 47,4 41,9 53,7
E1b1b1a E1b1b1b 39,6 35,0 44,9
E1b1b1a1a E1b1b1a1b 14,8 13,1 16,8
C1 C2 53,3 47,1 60,5
G HIJK 56,9 50,3 64,6
H IJK 56,4 49,9 64,0
IJ K 55,2 48,8 62,6
I J 49,9 44,1 56,6
I1 I2 32,9 29,0 37,3
J1 J2 37,1 32,8 42,1
J2a J2b 32,6 28,8 37,0
LT MNOPS 53,4 47,2 60,6
L T 51,0 45,0 57,8
NO MPS 52,8 46,7 59,9
MS P 52,8 46,7 59,9
M S 52,7 46,6 59,8
N O 46,7 41,2 52,9
O1 O2 38,5 34,0 43,7
Q R 37,7 33,3 42,8
Q1a Q1b 35,4 31,2 40,1
R1 R2 32,4 28,7 36,8
R1a R1b 25,6 22,6 29,0
R1b1a2a2 R1b1a2a1 7,8 6,9 8,9
R1a1a1b1 R1a1a1b2 6,2 5,5 7,1
†Assigned using ISOGG v11.01
‡Based on 95% HPD Interval of the mutation rate estimate


 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100