АвторТема: дДНК из Сидона(Ливан), бронзовый век(1700 лет до н.э.)  (Прочитано 8187 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1580
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2093/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
http://biorxiv.org/content/early/2017/05/26/142448

Continuity and admixture in the last five millennia of Levantine history from ancient Canaanite and present-day Lebanese genome sequences

Marc Haber, Claude Doumet-Serhal, Christiana Scheib, Yali Xue, Petr Danecek, Massimo Mezzavilla, Sonia Youhanna, Rui Martiniano, Javier Prado-Martinez, Michał Szpak, Elizabeth Matisoo-Smith, Holger Schutkowski, Richard Mikulski, Pierre Zalloua, Toomas Kivisild, Chris Tyler-Smith

doi: https://doi.org/10.1101/142448

Abstract

The Canaanites inhabited the Levant region during the Bronze Age and established a culture which became influential in the Near East and beyond. However, the Canaanites, unlike most other ancient Near Easterners of this period, left few surviving textual records and thus their origin and relationship to ancient and present-day populations remain unclear. In this study, we sequenced five whole-genomes from ~3,700-year-old individuals from the city of Sidon, a major Canaanite city-state on the Eastern Mediterranean coast. We also sequenced the genomes of 99 individuals from present-day Lebanon to catalogue modern Levantine genetic diversity. We find that a Bronze Age Canaanite-related ancestry was widespread in the region, shared among urban populations inhabiting the coast (Sidon) and inland populations (Jordan) who likely lived in farming societies or were pastoral nomads. This Canaanite-related ancestry derived from mixture between local Neolithic populations and eastern migrants genetically related to Chalcolithic Iranians. We estimate, using linkage-disequilibrium decay patterns, that admixture occurred 6,600-3,550 years ago, coinciding with massive population movements in the mid-Holocene triggered by aridification ~4,200 years ago. We show that present-day Lebanese derive most of their ancestry from a Canaanite-related population, which therefore implies substantial genetic continuity in the Levant since at least the Bronze Age. In addition, we find Eurasian ancestry in the Lebanese not present in Bronze Age or earlier Levantines. We estimate this Eurasian ancestry arrived in the Levant around 3,750-2,170 years ago during a period of successive conquests by distant populations such as the Persians and Macedonians.

Хананеи населяли область Леванта во время бронзового века и создали культуру, которая стала влиятельной на Ближнем Востоке и за его пределами. Однако хананеи, в отличие от большинства других древних ближневосточных жителей этого периода, оставили мало сохранившихся текстовых записей, и поэтому их происхождение и связь с древним и современным населением остаются неясными. В этом исследовании мы секвенировали пять полных геномов у 3700-летних индивидуумов из города Сидон, крупного города-государства ханаанцев на восточном побережье Средиземного моря. Мы также секвенировали геномы 99 лиц из современного Ливана для каталогизации современного левантийского генетического разнообразия. Мы обнаружили что генетический компонент связанный с хананенями бронзового века был широко распространен в регионе, как среди городского населения побережья(Сидон), так и среди населения вглуби континента(Иордания), которое занималось земледелием или скотоводством. Этот генетический компонент, связанный с хананенями, произошёл от смешения между местными неолитическими популяциями и восточными мигрантами, генетически связанными с населением Ирана медного века. По нашим оценкам, с использованием диаграмм распада неравновесного сцепления эта примесь произошла 6600-3550 лет назад, что совпало с массовыми перемещениями населения в середине голоцена, вызванными аридизацией ~ 4200 лет назад. Мы показываем, что нынешние ливанцы происходят большей частью от популяции, связанной с хананеями, что, следовательно, подразумевает существенную генетическую преемственность в Леванте, по крайней мере с бронзового века. Кроме того, мы находим евразийский генетический компонент  у современных ливанцев, не обнаруженный в бронзовом веке или у более ранних левантийцев. По нашим оценкам, этот евразийский генетический компонент прибыл в Левант около 3750-2170 лет назад в период последовательных завоеваний отдаленными популяциями, такими как персы и македонцы.

Идентификатор Возраст Покрытие Пол мтДНК Y-ДНК
EGAN00001390967 3,700a 1.19 M N1a3a J-P58 (J1a2b)
EGAN00001390965 3,650b 1.69 M HV1b1 J-M12 (J2b)
EGAN00001390961 3,650b 1.24 F K1a2
EGAN00001390963 3,750b 2.32 F R2
EGAN00001390952 3,750b 0.40 F H1bc
« Последнее редактирование: 27 Май 2017, 00:31:27 от rozenblatt »

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1580
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2093/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Некоторые интересные места из статьи:

Эти образцы относятся к 1700 г. до н.э., примерно тогда же термин Ханаан впервые появляется в источниках из Мари.

Греческое название ханаанцев - финикийцы.

Из всех современных популяций к ханаанеям больше всего близки ливанцы-христиане.

В плане фенотипа ханаанеи похожи на современных ливанцев, однако видимо были более темнокожими: Sidon_BA probably having darker skin than Lebanese today from variants in SLC45A2 resulting in darker pigmentation.

В генетическом плане они весьма похожи на иорданцев бронзового века. Ханаанеев можно представить как смесь 48.4± 4.2% неолитических левантийцев 51.6± 4.2% иранцев медного века. Это смешение случилось  ~5,000 ± 1,500 лет назад. Однако современных ливанцев такой смесью представить нельзя. Нужен дополнительный компонент. На его роль лучше всего подходит связанный с EHG и населением степи. Его нужно 11-22%. Современных ливанцев можно представить как смесь 93±1.6% хананеев и 7±1.6% степняков бронзового века. Дата смешения оценивается в 2,950±790 лет назад. Тут правда стоит отметить что вряд ли в Ливан мигрировали несмешанные степняки, скорее всего это были уже смешанные популяции.
« Последнее редактирование: 27 Май 2017, 03:41:38 от rozenblatt »

Оффлайн Arame

  • Сообщений: 962
  • Страна: am
  • Рейтинг +388/-1
  • J1-Z1842
Цитировать
Нужен дополнительный компонент. На его роль лучше всего подходит связанный с EHG и населением степи. Его нужно 11-22%. Современных ливанцев можно представить как смесь 93±1.6% хананеев и 7±1.6% степняков бронзового века. Дата смешения оценивается в 2,950±790 лет назад.

Ах. Эта дата близка к дате экспансии Мушки и Уруму многие из которых попали в Левант.

Хотя в эту эпоху уже и Скифы и Киммеры тоже подвозили EHG. И про народы моря тоже не забудем.
« Последнее редактирование: 27 Май 2017, 11:44:40 от Arame »

Оффлайн Arame

  • Сообщений: 962
  • Страна: am
  • Рейтинг +388/-1
  • J1-Z1842
Кстати тут много было споров кто самый первый и изначальный ПИЕ.
Вот вам и наглядный пример что быть изначальным не всегда идет в пользу. Е был изначально Афро азиатом. А эти J из Иран Кавказа не были. Что получилось в итоге видим сами.

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 14497
  • Страна: id
  • Рейтинг +939/-35
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Эта дата близка к дате экспансии Мушки и Уруму многие из которых попали в Левант.
Ещё такой вариант может быть: https://en.wikipedia.org/wiki/Syro-Hittite_states
Цитировать
The states that are called Neo-Hittite, or more recently Syro-Hittite were Luwian-, Aramaic- and Phoenician-speaking political entities of the Iron Age
 in northern Syria and southern Anatolia that arose following the collapse of the Hittite Empire around 1180 BC and which lasted until roughly 700 BC.
И ещё раньше даже проникновение хеттcких текстов по побережью Леванта (Угарит, Сумур) :
http://lingvarium.org/maps/asia/Anatolia_17-7bc.png карта

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5326
  • Страна: ru
  • Рейтинг +421/-49
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Это вроде бы не первые J2b и J1 с тех краев.

Early Bronze   Jordan   'Ain Ghazal [I1730 / AG 84_30]   M   2489-2299 calBCE (3925±31 BP)  J (xJ1,J2a, J2b2a) [J2b1-PF7331]

Early Bronze   Jordan   'Ain Ghazal [I1705 / AG 98_1]   M   2198-1966 calBCE (3690±35 BP)  J1 (xJ1a)   M267+ (M365.1-)

И что интересно в обеих случаях обнаружены парой.  :)

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Если.  их рассматривать как предки -потомки , то возможно являются J1a2b3a и J2b2a1a1
бред полный :)

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18723
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4702/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Это вроде бы не первые J2b и J1 с тех краев.

Early Bronze   Jordan   'Ain Ghazal [I1730 / AG 84_30]   M   2489-2299 calBCE (3925±31 BP)  J (xJ1,J2a, J2b2a) [J2b1-PF7331]

Early Bronze   Jordan   'Ain Ghazal [I1705 / AG 98_1]   M   2198-1966 calBCE (3690±35 BP)  J1 (xJ1a)   M267+ (M365.1-)

И что интересно в обеих случаях обнаружены парой.  :)

Они и аутосомно похожи.

Figure 1. Population locations and genetic structure. (A) The map shows the location of the newly sequenced Bronze Age Sidon samples (pink triangle labelled with red text), as well as the locations of published ancient samples used as comparative data in this study. (B) PCA of ancient Eurasian samples (colored shapes) projected using eigenvectors from present-day Eurasian populations (grey points).

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18723
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4702/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Я так понимаю, это полная версия вышла?

Continuity and Admixture in the Last Five Millennia of Levantine History from Ancient Canaanite and Present-Day Lebanese Genome Sequences

Marc Haber, Claude Doumet-Serhal, Christiana Scheib, Yali Xue, Petr Danecek, Massimo Mezzavilla, Sonia Youhanna, Rui Martiniano, Javier Prado-Martinez, Michał Szpak, Elizabeth Matisoo-Smith, Holger Schutkowski, Richard Mikulski, Pierre Zalloua, Toomas Kivisild, Chris Tyler-Smith

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1580
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2093/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Я так понимаю, это полная версия вышла?

Continuity and Admixture in the Last Five Millennia of Levantine History from Ancient Canaanite and Present-Day Lebanese Genome Sequences

Marc Haber, Claude Doumet-Serhal, Christiana Scheib, Yali Xue, Petr Danecek, Massimo Mezzavilla, Sonia Youhanna, Rui Martiniano, Javier Prado-Martinez, Michał Szpak, Elizabeth Matisoo-Smith, Holger Schutkowski, Richard Mikulski, Pierre Zalloua, Toomas Kivisild, Chris Tyler-Smith

Она самая.

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1467
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1523/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
А по прошлогоднему анонсу о 145 останках пока нет дДНК?
http://www.bbc.com/news/world-middle-east-36759340
Researchers in Israel have made what they say is the first discovery of a Philistine cemetery.
The discovery, made in 2013 and finally revealed on Sunday, may yield answers to an enduring mystery surrounding the origins of the Philistines

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 392
  • Страна: ru
  • Рейтинг +159/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
99 современных ливанцев тоже интересны.
Цитировать
Sequencing data for 99 present-day Lebanese individuals reported in this paper are available through the European Genome-phenome Archive (EGA) under accession number EGA: EGAS00001002084. Raw sequencing reads for 5 ancient Canaanite individuals are available through the European Nucleotide Archive (ENA) under accession number ENA: PRJEB21330. Aligned sequences and genotypes can be obtained from the corresponding authors.

35 из них они поместили на дерево гаплогруппы J:


Интересно, что там у них по другим гаплогруппам, в частности, по R1a.

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 392
  • Страна: ru
  • Рейтинг +159/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Какие там еще гаплогруппы должны быть среди этих 99 - можно оценить по этой картинке:

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18723
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4702/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
J1a2b в ISOGG 2017 – это Z1828. Интересно, какую версию ISOGG здесь использовали?

CLM.HG01494, который на дереве в публикации указан как J1a3 - это колумбиец из Медельина, на дереве YFull он находится в CTS7188*. В ISOGG 2017 это гаплогруппа J1a2b1b2c-CTS7188.
« Последнее редактирование: 28 Июль 2017, 08:25:31 от Yaroslav »

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
User,
В подписи к Рис.написано, какую версию использовали. От 2016.
Сама путаюсь с меняющемися буквенными обозначениями. Координатор проекта L24 Al Aburto написал, что левая часть Рис.это L24. Надо разобраться со снипами.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.