U4a

[wertner]

Пришли результаты из 23andMe. Они определили мне U4.
Посмотрел http://www.phylotree.org/tree/subtree_U.htm
Участки, которые определяют U4a, U4b, U4c, U4d (8818, 7705, 10907, 629  2405.1C) они не анализируют.
Но если смотреть вложенные субклады (U4a1..U4d2), то у меня есть мутации 152С, 12937G которые определяют U4a1 и мутация 310C, которая определяет U4a2.
Других мутаций внутри всей U4 у меня нет (там где 23andMe анализирует).
Так кто же я, U4a1 или U4a2?

Все мутации:
11332T
11467G
11719A
12308G
12372A
12937G
14620T
14766T
152C
15326G
15693C
15884T
16093A
16129C
1811G
195A
263G
2706G
310C
3552A
4646C
4769G
499A
5999C
6047G
7028T
73G
750G
825C
8285I

[I2a1a]

Надо у Валерия спросить.

[Alesh]

U4a1   152C, 12937G, 16134T
У меня почти всё тоже самое, но как и у тебя нет мутации 16134T и нет 12937G
Поэтому определили как
U4a2   310C

Кроме этого хочу заметить на нашу
U4   195C , 4646C, 6047G, 14620T, 15693C, 16356C
У тебя значится 195A, как и у меня, без учёта  transition (A-G) нужно исправлять на “C”


на FTDNA у меня нашли
HVR1 differences from CRS
16356C
16519C
HVR2 differences from CRS
143A
523.1C
523.2A
(это список только не вошедших  в тест 23andMe)

Я думаю, что у тебя всё-таки U4a2, а если у тебя HVR1 16356T то и U4a2a

[Ухряб]

Привет, родня!
У меня тоже u4a, что с этим делать?

[пенелопа]

Привет, родня!
У меня тоже u4a, что с этим делать?

Здравствуйте! С этим надо жить!

Карта:

http://gentis.ru/info/mtdna-tutorial/hg-u/u4

[пенелопа]

Там же результаты исследований палеоДНК:

Гг   Возраст          N   Арх. культура, регион   
U4    6,350 до н.э.    1    Spiginas (Kunda Culture), Литва    Bramanti et al. (2009)
U4    6,850 до н.э.    1    Bad Dürrenberg, Германия    Bramanti et al. (2009)
U4    3,500 до н.э.    1    Granollers (Catalonia), Испания    Sampietro et al. (2007)
U4    2,000 до н.э.    1    Xinjing Hami cemetery, Китай    -

И: http://mtdna.gentis.ru/hg/ages.htm#

[Srkz]

По U4 довольно много информации, но, к сожалению, без разделения на U4a и U4b. Яркое пятно на карте Гентиса, подозреваю, результат генетического дрейфа в одной из популяций. По распространенности U4a в Европе нашел вот такую табличку http://mbe.oxfordjournals.org/content/25/8/1651/T1.expansion.html
Populations    U4a1    U4a2    U4a2a    U4a2b    U4a2c
Eastern Europe (n = 4,008)abc    1.8 (74)    1.4 (57)    0.8 (31)    0.3 (9)    0.3 (13)
Central and eastern Europe (n = 2,016)a    1.0 (21)    1.9 (38)    1.2 (24)    0.4 (7)    0.1 (3)
Northeastern Europe (n = 1,013)b    0.9 (9)    0.8 (    0.6 (6)    0.2 (2)    0
Volga–Ural region (n = 979)c    4.5 (44)    1.1 (11)    0.1 (1)    0    1.0 (10)
Central and western Europe (n = 3,704)d    0.5 (19)    0.3 (12)    0.2 (9)    0.1 (2)    0

    NOTE.—The data were taken from the literature cited in supplementary table S2 (Supplementary Material online).

    ↵a Russians, Belorussians, Ukrainians, Poles, and Slovaks.

    ↵b Finns, Karelians, Estonians, Latvians, and Lithuanians.

    ↵c Maris, Komi-Zyrians, Komi-Permians, Mordwin, Udmurts, Chuwashes, Tatars, and Bashkirs.

    ↵d British, Germans, Czechs, Austrians, Swiss, Bosnians, Slovenians, Italians, French, Spaniards, and Portuguese.

А вот что пишет про нас Малярчук в работе "Сигналы адаптивной эволюции митохондриальных генов у европейцев":

Поскольку современные европейцы являются отчасти потомками европейского населения эпохи верхнего
плейстоцена, пережившего последнее оледенение, то вполне ожидаемым является присутствие в современ
ном генофонде европейцев адаптивных вариантов, возникших в ледниковое время.

Предполагается, что наиболее радикальные из
менения свидетельствуют о влиянии адаптации,
т.е. направленного отбора [11]. Результаты ана
лиза показали, что только три замены являются
радикальными (табл. 2). Одна из них возникла в
момент образования гаплогруппы U4, характер
ной для населения Восточной Европы, Запад
ной и Южной Сибири, и две замены возникли в
момент образования подгрупп U5a1 и U5a1a1b.

То есть возможно, что наша митогруппа U4 является результатом адаптации к холодному климату. Поэтому после окончания ледникового периода теплолюбивые пришельцы с юга нас почти вытеснили 

[Yurgan]

По U4 довольно много информации, но, к сожалению, без разделения на U4a и U4b. Яркое пятно на карте Гентиса, подозреваю, результат генетического дрейфа в одной из популяций. По распространенности U4a в Европе нашел вот такую табличку http://mbe.oxfordjournals.org/content/25/8/1651/T1.expansion.html
Populations    U4a1    U4a2    U4a2a    U4a2b    U4a2c
Eastern Europe (n = 4,008)abc    1.8 (74)    1.4 (57)    0.8 (31)    0.3 (9)    0.3 (13)
Central and eastern Europe (n = 2,016)a    1.0 (21)    1.9 (38)    1.2 (24)    0.4 (7)    0.1 (3)
Northeastern Europe (n = 1,013)b    0.9 (9)    0.8 (    0.6 (6)    0.2 (2)    0
Volga–Ural region (n = 979)c    4.5 (44)    1.1 (11)    0.1 (1)    0    1.0 (10)
Central and western Europe (n = 3,704)d    0.5 (19)    0.3 (12)    0.2 (9)    0.1 (2)    0

    NOTE.—The data were taken from the literature cited in supplementary table S2 (Supplementary Material online).

    ↵a Russians, Belorussians, Ukrainians, Poles, and Slovaks.

    ↵b Finns, Karelians, Estonians, Latvians, and Lithuanians.

    ↵c Maris, Komi-Zyrians, Komi-Permians, Mordwin, Udmurts, Chuwashes, Tatars, and Bashkirs.

    ↵d British, Germans, Czechs, Austrians, Swiss, Bosnians, Slovenians, Italians, French, Spaniards, and Portuguese.

А вот что пишет про нас Малярчук в работе "Сигналы адаптивной эволюции митохондриальных генов у европейцев":

Поскольку современные европейцы являются отчасти потомками европейского населения эпохи верхнего
плейстоцена, пережившего последнее оледенение, то вполне ожидаемым является присутствие в современ
ном генофонде европейцев адаптивных вариантов, возникших в ледниковое время.

Предполагается, что наиболее радикальные из
менения свидетельствуют о влиянии адаптации,
т.е. направленного отбора [11]. Результаты ана
лиза показали, что только три замены являются
радикальными (табл. 2). Одна из них возникла в
момент образования гаплогруппы U4, характер
ной для населения Восточной Европы, Запад
ной и Южной Сибири, и две замены возникли в
момент образования подгрупп U5a1 и U5a1a1b.

То есть возможно, что наша митогруппа U4 является результатом адаптации к холодному климату. Поэтому после окончания ледникового периода теплолюбивые пришельцы с юга нас почти вытеснили 

В любом случае, U4 хорошо коррелирует с миграциями уральцев - финно-угро-самодийцев.
Даже в Польше видимо это одна миграция с мужской N1c1.
Женские линии могут занять чуть большую территорию, чем сопутствующие им мужские за счет браков.
Но все же есть какой то предел.
Я U4a - точный субклад уточню, предки по бабушке из Могилевской губернии.

U4b характерна для тюрков южной Сибири.
Уважаемый Асан-Кайгы из этой группы.

[Yurgan]

Привет, родня!
У меня тоже u4a, что с этим делать?

Советую специфические мутации в coding region выложить здесь, тогда можно уточнить субклад.
В вставьте в подпись свой номер FTDNA, то по одному нику сложно определить какая у Вас мужская, какая женская линия

[Srkz]

В любом случае, U4 хорошо коррелирует с миграциями уральцев - финно-угро-самодийцев.
Даже в Польше видимо это одна миграция с мужской N1c1.
Женские линии могут занять чуть большую территорию, чем сопутствующие им мужские за счет браков.
Но все же есть какой то предел.
Я U4a - точный субклад уточню, предки по бабушке из Могилевской губернии.

U4b характерна для тюрков южной Сибири.
Уважаемый Асан-Кайгы из этой группы.

Да, и у мальчика со стоянки Мальта нашли U4, при этом в аутосомах у него на первом месте компонент Uralic. Но все же U4 и в палеолитической Европе была представлена широко, а вот насчет конкретно U4a ничего не скажу.

[Белгородец]

             У меня по анализу ГВС1 и ГВС 2 определили мито-группу как U4.
На ГВС1 у меня порядка 700 полных совпаденцев, а на ГВС1 + ГВС2 нет ни одного полного совпаденца.
На расстоянии от 1 до 3 мутаций у всех ближайших приближенцев или 310- или 310С, только с 4 мутаций начинается стандартное значение 310Т. Это значит, что меня и 310С разделяет одна мутация (310- - 310С или наоборот) или две мутации (у меня 310- - 310-, у приближенцев 310Т - 310С)?

[Людмила]

Белгородец, не понятен как-то вопрос. А у Вас что стоит в позиции 310? Вы написали, что у одного 310- (значит делеция, нет в этом месте нуклеотида), у другого - 310С(значит, цитозин), стандартное 310Т (тимин). Если у Вас с ближайшим совпаденцем 1 мутация по 310, значит, на 1 мутацию и различаетесь. Но не по всему мито-геному, а по ГВС1 + ГВС2 .

[Valery]

310C = 310del 315.1C. Выравнивающая программа может быть настроена так что первое дешевле второго, либо наоборот, но это технические условности.

[Белгородец]

Mitosearch определяет такую разницу как +1, -1, т.е. потенциально две мутации. Это значит, что нашим общим ближайшим предком по филогении был человек с 310Т.
Если же общим ближайшим предком был человек с 310- или 310С, то разница по 310 именно одна мутация.
На аутосомах (тест Family Finder) человек с разницей с одну или две мутации на ГВС1 + ГВС2 не виден, хотя его предки жили относительно недалеко от моих, в Тамбовской губернии (мои на юго-западе Курской губернии).

[Людмила]

Белгородец

На аутосомах (тест Family Finder) человек с разницей с одну или две мутации на ГВС1 + ГВС2 не виден, хотя его предки жили относительно недалеко от моих

А как Вы думаете, сколько лет могут разделять людей с 1 мутацией в  ГВС1 + ГВС2?
Например, по мито-группе моего отца V1a полное совпадение не ГВС1 + ГВС2, а всей последовательности мито-генома  дает время жизни общего предка от 0 до свыше 8 тыс.лет. Общего в аутосомах уже найти.